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Enregistrement W2897658702 · doi:10.14745/ccdr.v44i10a02

Ixodes scapularis tick distribution and infection rates in Ottawa, Ontario, 2017

2018· article· en· W2897658702 sur OpenAlexafffundvenueabout
Manisha A. Kulkarni, Roman Kryuchkov, A Statculescu, Charles Thickstun, Antonia Dibernardo, L. Robbin Lindsay, Benoit Talbot

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésIxodes scapularisBorrelia burgdorferiAnaplasma phagocytophilumLyme diseaseTickAnaplasmosisBiologyBorreliaTick-borne diseaseVeterinary medicineVirologyIxodidaeMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The incidence of Lyme disease has increased in many regions of Canada in recent years, including in Ottawa, Ontario.To date there has been limited active tick surveillance in the region.Objectives: To estimate both the distribution and density of Ixodes scapularis ticks in the city of Ottawa, and the infection rates of ticks with Borrelia burgdorferi (that causes Lyme disease) and other tick-borne pathogens.Methods: Between June and October 2017, tick surveillance was conducted by drag sampling at 23 sites in Ottawa municipal parks, recreational trails and forests.Blacklegged ticks were tested for B. burgdorferi, Borrelia miyamotoi and Anaplasma phagocytophilum using quantitative polymerase chain reaction protocols.Results: I. scapularis ticks were found in 16 of the 23 sites (70%).Recreational trails, conservation areas/forests and the provincial park within the city of Ottawa had significantly higher tick densities than municipal parks (p<0.01).Of the 194 adult and 26 nymphal I. scapularis tested, prevalence of infection was 29.5% for B. burgdorferi, 0.45% for B. miyamotoi and 0.91% for A. phagocytophilum.Conclusion: Almost 30% of I. scapularis ticks tested in suburban and rural areas of the city of Ottawa were infected with B. burgdorferi, known to cause Lyme disease.Other types of infection, known to cause anaplasmosis and tick-borne relapsing fever, were also detected, although were very rare.Conducting active tick surveillance at the local level may help to inform risk assessment and public health actions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2018
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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