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Enregistrement W2897689714 · doi:10.1016/j.jalz.2018.06.2237

IC‐P‐170: A SIGNATURE OF BRAIN ATROPHY HIGHLY PREDICTIVE OF PROGRESSION TO ALZHEIMER'S DEMENTIA AND COGNITIVE DECLINE

2018· article· en· W2897689714 sur OpenAlexaff
Angela Tam, Christian Dansereau, Yasser Iturria‐Medina, Sebastian Urchs, Pierre Orban, John C.S. Breitner, Pierre Bellec

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de MontréalInstitut Universitaire de Gériatrie de MontréalDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityDouglas College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtrophyGrey matterDementiaVoxel-based morphometryLogistic regressionBrain sizeVoxelPsychologyInternal medicineNeuroimagingMagnetic resonance imagingMedicineArtificial intelligenceNeuroscienceWhite matterRadiologyComputer scienceDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many works have aimed at finding biomarkers in order to predict future progression to Alzheimer's dementia (AD) in individuals with mild cognitive impairment (MCI). However, this problem is challenging given that AD is a heterogeneous disorder. We present a brain signature of grey matter atrophy shared by a subset of patients with MCI that is highly predictive of progression to AD within 3 years. We used baseline T1 scans from 1136 subjects (controls, MCI, AD) from the ADNI1 and ADNI2 cohorts to generate individual voxel-based morphometry maps with SPM. Hierarchical clustering was used to reduce the number of features by identifying 7 subgroups of subjects, within ADNI1 AD and controls, based on similarity of atrophy. We derived spatial correlations between each individual's map to the mean of each subgroup, termed subtype weights, and used these subtype weights, along with age, gender, mean grey matter volume, and total intracranial volume, as features in our support vector machine to classify controls and AD from ADNI1. Then we trained a logistic regression classifier to identify AD patients with high-confidence predictions and obtain a highly predictive signature of AD (HPS+) in ADNI1 (Figure 1). After we optimized our hyperparameters on stable and progressor MCI (sMCI and pMCI respectively) from ADNI1, we applied our model to the ADNI2 dataset to classify 1) AD vs controls and 2) sMCI vs pMCI. Seven subtypes of grey matter atrophy and their coefficients, along with sex, age, mean grey matter volume (GMV) and total intracranial volume (TIV), for the resulting model to predict AD patients with high specificity. We achieved at least 90% specificity in identifying AD and pMCI patients in each of the training and replication samples. HPS+ subjects were more likely to be progressors. HPS+ subjects also had significantly worse baseline cognition and declined at a faster rate, compared to low-confidence subjects (Non-HPS+) and subjects who were flagged as negative (Figure 2). However, HPS+ subjects did not differ in amyloid or tau burden or APOE4 positivity. Characteristics of MCI subjects with a highly predictive brain signature of progression to Alzheimer's dementia (HPS+), MCI subjects with a low-confidence prediction (Non-HPS+), and MCI subjects who were not flagged as hits (Negative) in a) ADNI1 and b) ADNI2. ADAS13: Alzheimer Disease Assessment Scale - Cognitive. Significant differences are denoted by * for p <0.05 and ** for p< 0.001. With a new machine learning algorithm, we found an anatomical MRI brain signature that is highly predictive of future conversion to AD dementia in a subset of MCI patients. The results of this work may be developed into methods for earlier diagnosis and enrichment in clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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