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Enregistrement W2897766844 · doi:10.1111/asj.13093

Identification and frequency of the associated genes with virulence and antibiotic resistance of <i>Escherichia coli</i> isolated from cow's milk presenting mastitis pathology

2018· article· en· W2897766844 sur OpenAlex
Hossein Jamali, Kateryna Krylova, Mohammed Aïder

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAnimal Science Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceEscherichia coliMastitisBiologyMicrobiologyTetracyclineAntibiotic resistanceAntimicrobialIntegronStreptomycinPhylogenetic treeGeneAntibioticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antimicrobial resistance, genotype, and virulence gene content of Escherichia coli isolated from bovine clinical mastitis in Tehran Province, Iran, were studied. Two hundred seven (207) milk samples from individual cows presenting mastitis symptoms collected from different dairy farms were used to determine the presence of specific genes of E. coli responsible for this pathology. Multiplex PCR was used to differentiate E. coli isolates into different phylogenetic groups/subgroups and to detect their virulence and involved resistance genes. All the isolated strains were tested for the susceptibility to 21 antimicrobial agents. The results showed that E. coli was detected in 42 (20.3%) samples and 69% of them belonged to the phylogenetic groups A and B1. The phylogenetic subgroup A1 (31%) and subgroup B1 (28.6%) demonstrated the highest prevalence of virulence genes (f17c-A, and eae (n = 6), f17b-A, and f17d-A (n = 5), afaD-8, afaE-8, aucD, and bfpA (n = 4), clpG and VT (n = 2), and LT and ST genes (n = 1)). The highest antimicrobial resistance was observed for tetracycline (45.2%) followed by streptomycin (26.2%). The antimicrobial resistance genes tetB (31%), tetA (28.6%), and aadA (26.2%) were the most prevalent. Moreover, integron class 1 and 2 were found in 24 (57.1%) and 8 (19%) of the E. coli isolates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,695
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle