Identification and frequency of the associated genes with virulence and antibiotic resistance of <i>Escherichia coli</i> isolated from cow's milk presenting mastitis pathology
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Antimicrobial resistance, genotype, and virulence gene content of Escherichia coli isolated from bovine clinical mastitis in Tehran Province, Iran, were studied. Two hundred seven (207) milk samples from individual cows presenting mastitis symptoms collected from different dairy farms were used to determine the presence of specific genes of E. coli responsible for this pathology. Multiplex PCR was used to differentiate E. coli isolates into different phylogenetic groups/subgroups and to detect their virulence and involved resistance genes. All the isolated strains were tested for the susceptibility to 21 antimicrobial agents. The results showed that E. coli was detected in 42 (20.3%) samples and 69% of them belonged to the phylogenetic groups A and B1. The phylogenetic subgroup A1 (31%) and subgroup B1 (28.6%) demonstrated the highest prevalence of virulence genes (f17c-A, and eae (n = 6), f17b-A, and f17d-A (n = 5), afaD-8, afaE-8, aucD, and bfpA (n = 4), clpG and VT (n = 2), and LT and ST genes (n = 1)). The highest antimicrobial resistance was observed for tetracycline (45.2%) followed by streptomycin (26.2%). The antimicrobial resistance genes tetB (31%), tetA (28.6%), and aadA (26.2%) were the most prevalent. Moreover, integron class 1 and 2 were found in 24 (57.1%) and 8 (19%) of the E. coli isolates.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle