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Enregistrement W2897786986 · doi:10.1107/s1600577518010895

A comparison of parametric and integrative approaches for X-ray fluorescence analysis applied to a Stroke model

2018· article· en· W2897786986 sur OpenAlexafffund
Andrew M. Crawford, Nicole J. Sylvain, Huishu Hou, Mark J. Hackett, M. Jake Pushie, Ingrid J. Pickering, Graham N. George, Michael Kelly

Notice bibliographique

RevueJournal of Synchrotron Radiation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of SaskatchewanOffice of ScienceNational Institutes of HealthUniversity of SaskatchewanU.S. Department of Energy
Mots-clésPixelParametric statisticsComputer scienceFluorescence-lifetime imaging microscopyPoint (geometry)SIGNAL (programming language)VisualizationResolution (logic)Energy (signal processing)FluorescencePhysicsArtificial intelligenceOpticsMathematicsStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synchrotron X-ray fluorescence imaging enables visualization and quantification of microscopic distributions of elements. This versatile technique has matured to the point where it is used in a wide range of research fields. The method can be used to quantitate the levels of different elements in the image on a pixel-by-pixel basis. Two approaches to X-ray fluorescence image analysis are commonly used, namely, (i) integrative analysis, or window binning, which simply sums the numbers of all photons detected within a specific energy region of interest; and (ii) parametric analysis, or fitting, in which emission spectra are represented by the sum of parameters representing a series of peaks and other contributing factors. This paper presents a quantitative comparison between these two methods of image analysis using X-ray fluorescence imaging of mouse brain-tissue sections; it is shown that substantial errors can result when data from overlapping emission lines are binned rather than fitted. These differences are explored using two different digital signal processing data-acquisition systems with different count-rate and emission-line resolution characteristics. Irrespective of the digital signal processing electronics, there are substantial differences in quantitation between the two approaches. Binning analyses are thus shown to contain significant errors that not only distort the data but in some cases result in complete reversal of trends between different tissue regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,623
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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