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Enregistrement W2898012179 · doi:10.1093/annonc/mdy283.105

Predictive radiomics signature for treatment response to nivolumab in patients (pts) with advanced renal cell carcinoma (RCC)

2018· article· en· W2898012179 sur OpenAlexaff
Hao‐Wen Sim, A. B. Stundžia, Sabrina Pierre, Ur Metser, Martin O’Malley, Elena Elimova, Srikala S. Sridhar, Aaron R. Hansen

Notice bibliographique

RevueAnnals of Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineNivolumabRenal cell carcinomaRadiomicsRadiologyNephrectomyBiopsyImaging biomarkerClear cell renal cell carcinomaOncologyInternal medicineMagnetic resonance imagingImmunotherapyKidneyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Although nivolumab has been widely adopted as a treatment for advanced RCC, only a minority of pts benefit. We aimed to use radiomics as a predictive biomarker. By extracting quantitative information from serial imaging, this non-invasive method captures the spatial and temporal heterogeneity of tumors, more than tissue biopsy. We hypothesized to find an imaging correlate of host immune recognition, characterized by infiltration of the invasive tumor margin by immune effector cells, that would identify pts to benefit from nivolumab. Methods: We retrospectively identified all advanced RCC pts treated with nivolumab at our institution from 2013-2017. Pts were labelled as responders (CR / PR / durable SD) or non-responders based on clinical data. For each pt, lesions were contoured from pre-treatment and first on-treatment CT scans. All lesions were manually contoured in tandem by two trained investigators. This information was used to train a radial basis function support vector machine classifier to learn a prediction rule to distinguish responders versus non-responders. The classifier was internally validated by 10-fold nested cross-validation. Results: 37 pts were identified. Excluded: imaging unavailable = 3, incompatible CT protocols = 7. 104 lesions were contoured from 27 pts. Median age 56 years, 78% male, 89% clear cell histology, 89% prior nephrectomy, 89% prior systemic therapy. 19 responders vs 8 non-responders. Lesions: 60% lymph nodes, 23% lung metastases, 17% renal/adrenal metastases. For the classifier trained on the baseline CT scans, 69% accuracy was achieved. For the classifier trained on the first on-treatment CT scans, 66% accuracy was achieved. Conclusions: Based on preliminary computations, the radiomics signature could discriminate nivolumab responders from non-responders. Additional texture feature analysis with over 72 billion calculations is underway to improve the classifier performance to discriminate tumor responses to immunotherapy. External validation against the comprehensive patient dataset from the International Metastatic Renal Cell Cancer Database Consortium is planned. Legal entity responsible for the study: Dr Hao-Wen Sim and Dr Aaron Hansen. Funding: Awarded $40,000 from peer-reviewed 2017 GUMOC Astellas Research Grant. Disclosure: All authors have declared no conflicts of interest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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