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Enregistrement W2898019584 · doi:10.1093/ofid/ofy260

Clinical Validation of a Commercial LAMP Test for Ruling out Malaria in Returning Travelers: A Prospective Diagnostic Trial

2018· article· en· W2898019584 sur OpenAlex
James Cheaveau, Hong Nguyen, Barbara L. Chow, Dewdunee Marasinghe, Abu Naser Mohon, Hongbin Yuan, Gisele M. R. Viana, Donelly A. van Schalkwyk, Deirdre L. Church, Wilson Chan, Dylan R. Pillai

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensProvincial Laboratory of Public HealthMcGill UniversityCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCalgary Laboratory Services
Mots-clésMedicineMalariaTest (biology)Clinical trialMedical physicsDiagnostic testFamily medicineOptometryPediatricsInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malaria assay (loop-mediated isothermal amplification [LAMP]) was conducted comparing it with reference microscopy and RDTs (BinaxNOW Malaria) in returning travelers between June 2017 and January 2018. Returning travelers with signs and symptoms of malaria were enrolled in the study. RDTs, microscopy, and LAMP assays were performed simultaneously. A total of 298 patients (50.7% male; mean age, 32.5 years) were enrolled, most visiting friends and relatives (43.3%), presenting with fever (88.9%), not taking prophylaxis (82.9%), and treated as outpatients (84.1%). In the prospective arm (n = 348), LAMP had a sensitivity of 98.1% (95% confidence interval [CI], 90.0%-100%) and a specificity of 97.6% (95% CI, 95.2%-99.1%) vs microscopy. After discrepant resolution with real-time polymerase chain reaction, LAMP had a sensitivity of 100% (95% CI, 93.7%-100%) and a specificity of 100% (95% CI, 98.7%-100%) vs microscopy. After discrepant resolution, RDTs had a sensitivity of 83.3% (95% CI, 58.6%-96.4%) and a specificity of 96.2% (95% CI, 93.2%-98.1%) vs microscopy. When including retrospective specimens (n = 377), LAMP had a sensitivity of 98.8% (95% CI, 93.2%-100%) and a specificity of 97.6% (95% CI, 95.2%-99.1%) vs microscopy, and after discrepant resolution of this set, LAMP had a sensitivity of 100% (95% CI, 95.8%-100%) and a specificity of 100% (95% CI, 98.7%-100%). A cost-benefit analysis of reagents and labor suggests savings of up to USD$13 per specimen using a novel algorithm with LAMP screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,135
Score d'incertitude au seuil0,988

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle