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Enregistrement W2898122199 · doi:10.3390/ijms19113316

The 2β Splice Variation Alters the Structure and Function of the Stromal Interaction Molecule Coiled-Coil Domains

2018· article· en· W2898122199 sur OpenAlexafffund
Steve Chung, MengQi Zhang, Peter B. Stathopulos

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSTIM1ORAI1Coiled coilBiophysicsChemistryEndoplasmic reticulumCell biologyCytosolBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stromal interaction molecule (STIM)-1 and -2 regulate agonist-induced and basal cytosolic calcium (Ca2+) levels after oligomerization and translocation to endoplasmic reticulum (ER)-plasma membrane (PM) junctions. At these junctions, the STIM cytosolic coiled-coil (CC) domains couple to PM Orai1 proteins and gate these Ca2+ release-activated Ca2+ (CRAC) channels, which facilitate store-operated Ca2+ entry (SOCE). Unlike STIM1 and STIM2, which are SOCE activators, the STIM2β splice variant contains an 8-residue insert located within the conserved CCs which inhibits SOCE. It remains unclear if the 2β insert further depotentiates weak STIM2 coupling to Orai1 or independently causes structural perturbations which prevent SOCE. Here, we use far-UV circular dichroism, light scattering, exposed hydrophobicity analysis, solution small angle X-ray scattering, and a chimeric STIM1/STIM2β functional assessment to provide insights into the molecular mechanism by which the 2β insert precludes SOCE activation. We find that the 2β insert reduces the overall α-helicity and enhances the exposed hydrophobicity of the STIM2 CC domains in the absence of a global conformational change. Remarkably, incorporation of the 2β insert into the STIM1 context not only affects the secondary structure and hydrophobicity as observed for STIM2, but also eliminates the more robust SOCE response mediated by STIM1. Collectively, our data show that the 2β insert directly precludes Orai1 channel activation by inducing structural perturbations in the STIM CC region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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