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Enregistrement W2898221843 · doi:10.1093/ofid/ofy210.1277

1446. Correlation Between Adult Invasive and Noninvasive <i>Streptococcus pneumoniae</i> Disease in 13-Valent Pneumococcal Conjugate Vaccine Serotypes in the United States

2018· article· en· W2898221843 sur OpenAlexaff
Jose A Suaya, Adriano Arguedas, Rodrigo E. Mendes, Jelena Vojicic, David L. Swerdlow, Raúl Istúriz, Bradford D. Gessner

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensPfizer (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStreptococcus pneumoniaeSerotypeMedicinePneumoniaPneumococcal conjugate vaccinePneumococcal diseasePneumococcal pneumoniaConjugate vaccinePneumococcal vaccineCommunity-acquired pneumoniaMicrobiologyVirologyInternal medicineAntibioticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is often assumed that there is correlation of Streptococcus pneumoniae (Sp) serotype distribution between invasive (INV) and non-invasive (N-INV) disease. This retrospective analysis assessed the correlations of the 13-Valent Pneumococcal Conjugate Vaccine serotypes (PCV13-type) between INV and N-INV diseases in US adults during 2009–2016. For INV and N-INV pneumonia, we used a bank of Sp isolates from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program, where 105 centers across 40 states and nine US Census regions collected isolates from sterile or nonsterile respiratory specimen types from consecutive patients with pneumonia (one per patient). The official online US Active Bacterial Core (ABC) surveillance database for Sp was used for INV pneumococcal disease (IPD); ABCs conducts active surveillance in selected counties across 10 states in United States. Of 6,508 Sp isolates obtained from adults from the SENTRY database, 15% were from invasive pneumonia (mainly blood cultures). In 2009, PCV13 serotypes accounted for 55 and 37% of INV and N-INV pneumococcal pneumonia; in 2016, they accounted for 25 and 23%, respectively. Between 2009 and 2016, ABC reported 23,704 IPD cases in adults ≥18 years; PCV13 serotypes accounted for 53% in 2009 and 25% of IPD in 2016. The correlations between IPD (ABC) with INV pneumonia (SENTRY) and N-INV pneumonia (SENTRY) were: 0.937 and 0.973 (both P < 0.01), respectively (Table 1). The proportion of IPD and N-INV pneumonia due to vaccine serotypes decreased consistently and monotonically until 2014 and then plateaued (Figure 1). We found a strong correlation between databases (SENTRY and ABC) and between INV and N-INV pneumococcal disease in the proportion of disease due to PCV13 types. Our findings would need to be confirmed at the individual serotype level. The observed decrease in PCV13-type disease through 2014 is compatible with herd effect from PCV13 vaccination in children. The plateau suggests remaining disease that may be addressed by direct vaccination of adults. Surveillance of IPD alone could guide some policy on PCV13-type pneumococcal pneumonia. J. A. Suaya, A. G. Arguedas, D. L. Swerdlow, Pfizer Inc.: Employee and Shareholder, Salary. R. E. Mendes, Merck: Research Contractor, Research support. J. Vojicic, Pfizer: Employee and Shareholder, Benefits and stock and Salary. R. E. Isturiz, Pfizer, Inc: Employee and Shareholder, Salary and Stock & Stock Options. B. D. Gessner, Pfizer Inc.: Employee and Shareholder, Salary.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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