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Enregistrement W2898230105 · doi:10.3390/antibiotics7040092

Explorative Study on Isolation and Characterization of a Microviridae G4 Bacteriophage, EMCL318, against Multi-Drug-resistant Escherichia coli 15-318

2018· article· en· W2898230105 sur OpenAlexaffabout
Soumya Ghosh, Emma Persad, Ting-Yun Shiue, Cindy Lam, A K Islam, Lauren G. Mascibroda, Michael B. Sherman, Thomas J. Smith, Naowarat Cheeptham

Notice bibliographique

RevueAntibiotics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensSaint John Regional HospitalThompson Rivers University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEscherichia coliBacteriophageMicrobiologyGenBankSewageBacteriaBiologyAgarIsolation (microbiology)Agar plateEnterobacteriaceaePhage therapyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteriophages screened and isolated from sewage water samples exhibited antibacterial activities against multi-drug-resistant Escherichia coli strains. Five different water samples from Canadian habitats such as Kamloops Wastewater Treatment Center, Domtar, the Pacific Ocean, Bisaro Anima Cave, and alkali ponds, were used in this study. Four Enterobacteriaceae strains including one non-resistant and three clinical multi-drug Escherichia coli strains (E. coli 15-102, E. coli 15-124, and E. coli 15-318) were selected as target bacteria to screen for the bacteriophages from these collected water samples. Seeded agar assay technique was implemented for the screening. It was found that only sewage water sample exhibited a significant number of plaques count with the E. coli 15-318 (1.82 × 102 plaques/plate) cells in comparison to E. coli non-resistant strain K12 (8 plaques/plate). The phage did not produce plaques in the E. coli 15-124 and E. coli 15-102 strains. The bacteriophage, designated EMCL318, was isolated, purified, characterized, and identified to belong to the G4 species of the Family Microviridae, GenBank accession number MG563770. This is an explorative study conducted in order to reveal the viruses as alternative potentials to fight against emerging and existing multi-drug-resistant infectious diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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