Molecular taxonomy and phylogenetics of Daedaleopsis confragosa (Bolt.: Fr.) J. Schröt. From wild cherry in Serbia
Notice bibliographique
Résumé
Daedaleopsis spp., a lignicolous fungus causes of white rot on wild cherry and other broadleaved species and makes economic losses in Serbian forestry. The paper presents results of two morphologically distinct fungi Daedaleopsis confragosa and Daedaleopsis tricolor isolated from native populations of wild cherry (Prunus avium L.) found in the sites of Protected Forests of Serbia. Morphological appearance of D. tricolor was found more abundant in comparison to D. confragosa species. Samples from Serbia were analysed using morphometric and molecular tools and compared with isolates from United Kingdom and published sequences from Sweden, Austria, Hungary, Germany, Canada, France, USA and Czech Republic to give the taxonomic insight and their genetic relatedness using fungal barcoding region ITS rDNA. Results from BLAST search confirmed morphology of the isolates to their taxonomic affiliation as D. confragosa while sequence analysis showed mutations at several polymorphic positions that indicates genetic divergence to D. tricolor. Phylogenetic analysis presents narrow genetic relations of Serbian isolates with the one from United Kingdom while distinctness from other countries investigated specimens. Future work needs variable regions for both species to be amplified in order to evaluate species boundaries or employing NGS technologies in more detailed sequence analyses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».