Evaluation of RAPD markers as a marker-assisted selection tool for variety type and erucic acid content in rapeseed
Notice bibliographique
Résumé
Random amplification of polymorphic DNA (RAPD) analysis was performed on twelve rapeseed genotypes from Institute of Field and Vegetable Crops, Novi Sad, Serbia, genepool in order to identify markers that could be used in marker assisted selection (MAS) for different growing type and selection of the varieties with low or zero level of erucic acid. Out of fifteen RAPD markers, three were monomorphic, whereas twelve had polymorphic profiles. Three primers amplified specific fragments in spring varieties. UBC 25 and UBC 191 amplified the fragments of 450 and 750 bp, respectively, in all tested spring varieties, except in JR-NS-36. Primer UBC 72 generated a fragment of 700 bp that was present in all spring varieties. These fragments were not present in any of winter varieties. None of the tested RAPD primers amplified fragment(s) uniquely present either in varieties with or without (0%) erucic acid or with different erucic acid content. Cluster analysis showed a concordance between the position of varieties in the cluster and their pedigree information, but also enabled separation of spring and winter varieties. Contingency analysis confirmed that fragment UBC 72_700 is specific for spring varieties, while for erucic acid content, only moderate association was found with UBC 137_750.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».