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Enregistrement W2898348195 · doi:10.1007/s13127-018-0383-5

Cladogenesis and reticulation in Cuscuta sect. Denticulatae (Convolvulaceae)

2018· article· en· W2898348195 sur OpenAlexafffund
Miguel A. Garcı́a, Saša Stefanović, Catherine A. Weiner, Magdalena Olszewski, Mihai Costea

Notice bibliographique

RevueOrganisms Diversity & Evolution · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityAmgen (Canada)University of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCuscutaBiologyBotanyPhylogenetic treePopulationDisjunct distributionPhylogeneticsDisjunctEvolutionary biologyZoologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As traditionally circumscribed, Cuscuta sect. Denticulatae is a group of three parasitic plant species native to the deserts of Western USA ( Cuscuta denticulata , Cuscuta nevadensis ) and the central region of Baja California, Mexico ( Cuscuta veatchii ). Molecular phylogenetic studies confirmed the monophyly of this group and suggested that the disjunct C. veatchii is a hybrid between the other two species. However, the limited sampling left the possibility of alternative biological and methodological explanations. We expanded our sampling to multiple individuals of all the species collected from across their entire geographical ranges. Sequence data from the nuclear and plastid regions were used to reconstruct the phylogeny and find out if the topological conflict was maintained. We obtained karyotype information from multiple individuals, investigated the morphological variation of the group thorough morphometric analyses, and compiled data on ecology, host range, and geographical distribution. Our results confirmed that C. veatchii is an allotetraploid. Furthermore, we found previously unknown autotetraploid population of C. denticulata , and we describe a new hybrid species, Cuscuta psorothamnensis . We suggest that this newly discovered natural hybrid is resulting from an independent (and probably more recent) hybridization event between the same diploid parental species as those of C. veatchii . All the polyploids showed host shift associated with hybridization and/or polyploidy and are found growing on hosts that are rarely or never frequented by their diploid progenitors. The great potential of this group as a model to study host shift in parasitic plants associated with recurrent allopolyploidy is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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