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Enregistrement W2898419606 · doi:10.1038/s41437-018-0151-5

Genetic patterns in Neotropical Magnolias (Magnoliaceae) using de novo developed microsatellite markers

2018· article· en· W2898419606 sur OpenAlexaff
Emily Veltjen, Pieter Asselman, Majela Hernández Rodríguez, Alejandro Palmarola, Ernesto Testé Lozano, Luis Roberto González-Torres, Paul Goetghebeur, Isabel Larridon, Marie‐Stéphanie Samain

Notice bibliographique

RevueHeredity · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCocoa and Sweet Potato Agronomy
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBijzonder Onderzoeksfonds UGentVlaamse regeringMinisterio de Ciencia, Tecnología y Medio AmbienteUniversiteit GentFonds Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésBiologyMagnoliaceaeMicrosatelliteEvolutionary biologyGeneticsGenetic markerAlleleEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Conserving tree populations safeguards forests since they represent key elements of the ecosystem. The genetic characteristics underlying the evolutionary success of the tree growth form: high genetic diversity, extensive gene flow and strong species integrity, contribute to their survival in terms of adaptability. However, different biological and landscape contexts challenge these characteristics. This study employs 63 de novo developed microsatellite or SSR (Single Sequence Repeat) markers in different datasets of nine Neotropical Magnolia species. The genetic patterns of these protogynous, insect-pollinated tree species occurring in fragmented, highly-disturbed landscapes were investigated. Datasets containing a total of 340 individuals were tested for their genetic structure and degree of inbreeding. Analyses for genetic structure depicted structuring between species, i.e. strong species integrity. Within the species, all but one population pair were considered moderate to highly differentiated, i.e. no indication of extensive gene flow between populations. No overall correlation was observed between genetic and geographic distance of the pairwise species' populations. In contrast to the pronounced genetic structure, there was no evidence of inbreeding within the populations, suggesting mechanisms favouring cross pollination and/or selection for more genetically diverse, heterozygous offspring. In conclusion, the data illustrate that the Neotropical Magnolias in the context of a fragmented landscape still have ample gene flow within populations, yet little gene flow between populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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