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Enregistrement W2898461026 · doi:10.1016/j.ijpddr.2018.10.010

Investigating the function and possible biological role of an acetylcholine-gated chloride channel subunit (ACC-1) from the parasitic nematode Haemonchus contortus

2018· article· en· W2898461026 sur OpenAlexafffund
Micah K. Callanan, Sarah A. Habibi, Wen Jing Law, Kristen Nazareth, Richard L. Komuniecki, Sean G. Forrester

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Parasitology Drugs and Drug Resistance · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNicotinic Acetylcholine Receptors Study
Établissements canadiensOntario Tech University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésHomomericHaemonchus contortusChloride channelBiologyCaenorhabditis elegansLigand-gated ion channelIon channelProtein subunitXenopusAcetylcholine receptorCell biologyReceptorNematodePharmacologyMolecular biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cys-loop superfamily of ligand-gated ion channels are well recognized as important drug targets for many invertebrate specific compounds. With the rise in resistance seen worldwide to existing anthelmintics, novel drug targets must be identified so new treatments can be developed. The acetylcholine-gated chloride channel (ACC) family is a unique family of cholinergic receptors that have been shown, using Caenorhabditis elegans as a model, to have potential as anti-parasitic drug targets. However, there is little known about the function of these receptors in parasitic nematodes. Here, we have identified an acc gene (hco-acc-1) from the sheep parasitic nematode Haemonchus contortus. While similar in sequence to the previously characterized C. elegans ACC-1 receptor, Hco-ACC-1 does not form a functional homomeric channel in Xenopus oocytes. Instead, co-expression of Hco-ACC-1 with a previously characterized subunit Hco-ACC-2 produced a functional heteromeric channel which was 3x more sensitive to acetylcholine compared to the Hco-ACC-2 homomeric channel. We have also found that Hco-ACC-1 can be functionally expressed in C. elegans. Overexpression of both cel-acc-1 and hco-acc-1 in both C. elegans N2 and acc-1 null mutants decreased the time for worms to initiate reversal avoidance to octanol. Moreover, antibodies were generated against the Hco-ACC-1 protein for use in immunolocalization studies. Hco-ACC-1 consistently localized to the anterior half of the pharynx, specifically in pharyngeal muscle tissue in H. contortus. On the other hand, expression of Hco-ACC-1 in C. elegans was restricted to neuronal tissue. Overall, this research has provided new insight into the potential role of ACC receptors in parasitic nematodes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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