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Enregistrement W2898554474 · doi:10.33043/ff.2.2.82-91

Application of Molecular Techniques to Better Understand the Roles of Rumen Microbiota in Cattle Feed Efficiency

2016· article· en· W2898554474 sur OpenAlexaff
Jun Hong Liu, Le Luo Guan

Notice bibliographique

RevueFine Focus · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRumenBiologyResidual feed intakeFeed conversion ratioMicrobiomeBiomass (ecology)MetagenomicsBiotechnologyGreenhouse gasAnimal feedFood scienceDigestion (alchemy)MethaneBeef cattleAnimal scienceAgronomyFermentationChemistryBiochemistryBody weightEcologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Feed efficiency, simply expressed as less feed inputs versus animal production outputs, can be measured in several ways, such as feed conversion ratio (FCR) and residual feed intake (RFI). FCR is a common measurement in beef cattle operations, and is the ratio of feed intake to live-weight gain. RFI is defined as the difference between actual and predicted feed intake after taking into account variability in maintenance and growth requirements. Rumen microbiota, which inludes bacteria, archaea, protozoa, and fungi, play an essential role in the digestion of lignocellulosic plant biomass, and can provide more than 70% of the host ruminants energy requirements via the production of volatile fatty acids (VFAs). Methane, a potent greenhouse gas (GHG), is produced in large quantities by the rumen microbiota, and is a known contributor to the global increase in GHG emissions. Studies have shown a negative relationship between methane emission and feed efficiency. Therefore, there is a need to study the feed efficiency from a rumen microbiome perspective and explore the probability of improving feed efficiency and hence reduce methane production in cattle by manipulating the rumen microbiome. The development of high-throughput sequencing technologies incuding metagenomics and metatranscriptomic analyses in the past decade has led to a sharp increase in understanding the rumen microbiota and associated function. As such, this mini-review will focus on the new findings during the last decade in cattle feed efficiency and the rumen microbiome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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