A <i>Dehalogenimonas</i> Population Respires 1,2,4-Trichlorobenzene and Dichlorobenzenes
Notice bibliographique
Résumé
Chlorobenzenes are ubiquitous contaminants in groundwater and soil at many industrial sites. Previously, we demonstrated the natural attenuation of chlorobenzenes and benzene at a contaminated site inferred from a 5 year site investigation and parallel laboratory microcosm studies. To identify the microbes responsible for the observed dechlorination of chlorobenzenes, the microbial community was surveyed using 16S rRNA gene amplicon sequencing. Members of the Dehalobacter and Dehalococcoides are reported to respire chlorobenzenes; however, neither were abundant in our sediment microcosms. Instead, we observed a significant increase in the relative abundance of Dehalogenimonas from <1% to 16–30% during dechlorination of 1,2,4-trichlorobenzene (TCB), 1,2-dichlorobenzene (DCB), and 1,3-DCB over 19 months. Quantitative PCR (qPCR) confirmed that Dehalogenimonas gene copies increased by 2 orders of magnitude with an average yield of 3.6 ± 2.3 g cells per mol Cl – released ( N = 12). In transfer cultures derived from sediment microcosms, dechlorination of 1,4-DCB and monochlorobenzene (MCB) was carried out by Dehalobacter spp. with a growth yield of 3.0 ± 2.1 g cells per mol Cl – released ( N = 5). Here we show that a Dehalogenimonas population respire 1,2,4-TCB and 1,2-/1,3-DCB isomers. This finding emphasizes the need to monitor a broader spectrum of organohalide-respiring bacteria, including Dehalogenimonas, at sites contaminated with halogenated organic compounds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».