Структура частиц белка оболочки А вируса картофеля и их диссоциация
Notice bibliographique
Résumé
This paper reports on a complex structural analysis of the potato virus A coat protein using a set of complementary physico-chemical methods. We have demonstrated previously that this protein does not exist as individual subunits in solution and undergoes association into oligomers with subsequent transition to β-conformation. The purpose of the present work was to study the possible mechanisms of this transformation and to search for methods that dissociate protein oligomers. To analyze the low resolution protein structure in solution, small-angle X-ray scattering was used. Stable particles representing clusters of 30 coat protein subunits were present even in an aqueous salt solution with a high ionic strength and pH (pH 10.5; 0.5 M NaCl). The particles did not dissociate in the presence of 10 mM dextran sulfates (15 and 100 kDa). Dissociation in the presence of 5.2 mM sodium dodecyl sulfate results in the formation of the subunit-detergent complexes consisting of 10-12 small particles joined together like "beads on a string". Similar effects of sodium dodecyl sulfate were shown for serum albumins (bovine and human). Denaturation of the potato virus A coat protein molecules occurs in the presence of detergent concentrations that are seven times lower than that in albumins (5.2 and 35 mM), which confirms low stability of the potato virus A coat protein. Using spectral methods, preservation of the secondary structure and loss of the tertiary structure of the protein in its complex with sodium dodecyl sulfate have been demonstrated. Possible mechanism for protein particle formation through the interaction between unordered terminal domains and their transformation into β-structures has been suggested.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,017 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».