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Enregistrement W2898906372 · doi:10.1210/js.2018-00130

Predicted Benign and Synonymous Variants in CYP11A1 Cause Primary Adrenal Insufficiency Through Missplicing

2018· article· en· W2898906372 sur OpenAlex
Avinaash Maharaj, Federica Buonocore, Eirini Meimaridou, Gerard Ruiz‐Babot, Leonardo Guasti, Hwei‐Ming Peng, Cameron P. Capper, Neikelyn Burgos-Tirado, Rathi Prasad, Claire Hughes, Ashwini Maudhoo, Elizabeth Crowne, Timothy Cheetham, Caroline Brain, Jenifer P. Suntharalingham, Niccolò Striglioni, Bilgin Yüksel, Fatih Gürbüz, S Gupta, Robert S. Lindsay, Robert Couch, Helen Spoudeas, Tülay Güran, Stephanie Johnson, Dallas Fowler, Louise S. Conwell, Aideen McInerney‐Leo, D. Drui, Bertrand Cariou, Juan Pedro López‐Siguero, Mark Harris, Emma L. Duncan, Peter C. Hindmarsh, Richard J. Auchus, Malcolm Donaldson, John C. Achermann, Louise Metherell

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of the Endocrine Society · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdrenal Hormones and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthQueensland University of TechnologyGreat Ormond Street Hospital CharityNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilWellcomeBarts CharityQueen Mary University of LondonWellcome Trust
Mots-clésMissense mutationBiologyEtiologyCohortGeneticsAdrenal insufficiencyAlleleLoss of heterozygosityCholesterol side-chain cleavage enzymeCompound heterozygosityMedicineInternal medicineMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Primary adrenal insufficiency (PAI) is a potentially life-threatening condition that can present with nonspecific features and can be difficult to diagnose. We undertook next generation sequencing in a cohort of children and young adults with PAI of unknown etiology from around the world and identified a heterozygous missense variant (rs6161, c.940G>A, p.Glu314Lys) in CYP11A1 in 19 individuals from 13 different families (allele frequency within undiagnosed PAI in our cohort, 0.102 vs 0.0026 in the Genome Aggregation Database; P < 0.0001). Seventeen individuals harbored a second heterozygous rare disruptive variant in CYP11A1 and two had very rare synonymous changes in trans (c.990G>A, Thr330 = ; c.1173C>T, Ser391 =). Although p.Glu314Lys is predicted to be benign and showed no loss-of-function in an Escherichia coli assay system, in silico and in vitro studies revealed that the rs6161/c.940G>A variant, plus the c.990G>A and c.1173C>T changes, affected splicing and that p.Glu314Lys produces a nonfunctional protein in mammalian cells. Taken together, these findings show that compound heterozygosity involving a relatively common and predicted “benign” variant in CYP11A1 is a major contributor to PAI of unknown etiology, especially in European populations. These observations have implications for personalized management and demonstrate how variants that might be overlooked in standard analyses can be pathogenic when combined with other very rare disruptive changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle