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Enregistrement W2898998450 · doi:10.1186/s13567-018-0606-y

Characterization of the zinc metalloprotease of Streptococcus suis serotype 2

2018· article· en· W2898998450 sur OpenAlexafffund
Audrey Dumesnil, Jean-Philippe Auger, David Roy, Désirée Vötsch, Maren Willenborg, Peter Valentin‐Weigand, Pyong Woo Park, Daniel Grenier, Nahuel Fittipaldi, Josée Harel, Marcelo Gottschalk

Notice bibliographique

RevueVeterinary Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensCegep de Saint HyacinthePublic Health OntarioUniversity of TorontoUniversité LavalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésStreptococcus suisMicrobiologyBiologyVirulenceMetalloproteinaseProteaseSerotypeVirulence factorVirologyMatrix metalloproteinaseGeneEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Streptococcus suis is a swine pathogen and zoonotic agent responsible for meningitis and septic shock. Although several putative virulence factors have been described, the initial steps of the S. suis pathogenesis remain poorly understood. While controversial results have been reported for a S. suis serotype 2 zinc metalloprotease (Zmp) regarding its IgA protease activity, recent phylogenetic analyses suggested that this protein is homologous to the ZmpC of Streptococcus pneumonia e, which is not an IgA protease. Based on the previously described functions of metalloproteases (including IgA protease and ZmpC), different experiments were carried out to study the activities of that of S. suis serotype 2. First, results showed that S. suis , as well as the recombinant Zmp, were unable to cleave human IgA 1 , confirming lack of IgA protease activity. Similarly, S. suis was unable to cleave P-selectin glycoprotein ligand-1 and to activate matrix metalloprotease 9, at least under the conditions tested. However, S. suis was able to partially cleave mucin 16 and syndecan-1 ectodomains. Experiments carried out with an isogenic Δ zmp mutant showed that the Zmp protein was partially involved in such activities. The absence of a functional Zmp protein did not affect the ability of S. suis to adhere to porcine bronchial epithelial cells in vitro, or to colonize the upper respiratory tract of pigs in vivo. Taken together, our results show that S. suis serotype 2 Zmp is not a critical virulence factor and highlight the importance of independently confirming results on S. suis virulence by different teams.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,161
Tête enseignante GPT0,429
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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