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Enregistrement W2899191342 · doi:10.1016/j.nicl.2018.10.026

Profiling heterogeneity of Alzheimer's disease using white-matter impairment factors

2018· article· en· W2899191342 sur OpenAlexfundno aff
Xiuchao Sui, Jagath C. Rajapakse

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, San DiegoGenentechNational Institutes of HealthIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiMinistry of EducationMinistry of Education - SingaporeNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaUniversity of Southern CaliforniaNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbF. Hoffmann-La RocheAlzheimer's Drug Discovery FoundationAbbVieAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of HealthAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale Diagnostics
Mots-clésPrecuneusPsychologyWhite matterNeuroscienceApolipoprotein ECognitive declineTemporal lobeCorpus callosumCognitionDementiaDiseaseMedicinePathologyMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The clinical presentation of Alzheimer's disease (AD) is not unitary as heterogeneity exists in the disease's clinical and anatomical characteristics. MRI studies have revealed that heterogeneous gray matter atrophy patterns are associated with specific traits of cognitive decline. Although white matter (WM) impairment also contributes to AD pathology, its heterogeneity remains unclear. The Latent Dirichlet Allocation (LDA) method is a suitable framework to study heterogeneity and allows to identify latent impairment factors of AD instead of simply mapping an overall disease effect. By exploring whole brain WM skeleton images by using LDA, three latent factors were revealed in AD: a temporal-frontal impairment factor (temporal and frontal lobes, especially hippocampus and para-hippocampus), a parietal factor (parietal lobe, especially precuneus), and a long fibre bundle factor (corpus callosum and superior longitudinal fasciculus). As revealed by longitudinal analysis, the latent factors have distinct impact on cognitive decline: for executive function (EF), the temporal-frontal factor was more strongly associated with baseline EF compared with the parietal factor, while the long-fibre bundle factor was most associated with decline rate of EF; for memory, the three factors showed almost equal effect on the baseline memory and decline rate. For each participant, LDA estimates his/her composition profile of latent impairment factors, which indicates disease subtype. We also found that the APOE genotype affects the AD subtype. Specifically, APOE ε4 was more associated with the long fibre bundle factor and APOE ε2 was more associated with temporal-frontal factor. By investigating heterogeneity and subtypes of AD through white matter impairment factors, our study could facilitate precision medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,631

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,243
Tête enseignante GPT0,475
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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