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Enregistrement W2899335536 · doi:10.1101/458216

Antagonistic pathogen-mediated selection favours the maintenance of innate immune gene polymorphism in a widespread wild ungulate

2018· preprint· en· W2899335536 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxoplasma gondii Research Studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailInstitut National de la Recherche Agronomique
Mots-clésUngulateBalancing selectionInnate immune systemNatural selectionGenotypeGenetic diversityGenetic variationLoss of heterozygosityAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Toll-like Receptors (TLR) play a central role in recognition and host frontline defence against a wide range of pathogens. A number of recent studies have shown that TLR genes ( Tlrs ) often exhibit a large polymorphism in natural populations. Yet, there is little knowledge on how this polymorphism is maintained and how it influences disease susceptibility in the wild. In a previous work, we showed that some Tlrs exhibit similarly high levels of genetic diversity than Mhc and contemporary signatures of balancing selection in roe deer ( Capreolus capreolus ), an abundant and widespread ungulate in Europe. Here, we tested whether Mhc-Drb or Tlr ( Tlr2, Tlr4 and Tlr5 ) diversity is driven by pathogen-mediated selection. We examined the relationships between their genotype (heterozygosity status and presence of specific alleles) and infections with Toxoplasma and Chlamydia , two intracellular pathogens known to cause reproductive failure in ungulates. We showed that Toxoplasma and Chlamydia exposures vary significantly across year and landscape structure with few co-infection events detected, and that the two pathogens act antagonistically on Tlr2 polymorphism. By contrast, we found no evidence of association with Mhc-Drb and a limited support for Tlr heterozygosity advantage. Our study confirmed the importance of looking beyond Mhc genes in wildlife immunogenetic studies. It also emphasized the necessity to consider multiple pathogen challenges and their spatiotemporal variation to improve our understanding of vertebrate defence evolution against pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,258
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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