Tuberculosis drug resistance in Canada: 2017
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Drug-resistant tuberculosis (TB) is a global public health issue. To monitor this in Canada, surveillance systems have been in place for the last 20 years. OBJECTIVE: To describe drug resistance patterns among TB isolates in Canada in 2017 by type of resistance as well as geographic location, demographic data and origin and to compare current data to those of the previous 10 years. METHODS: Data were derived and analyzed from two sources. The Canadian Tuberculosis Laboratory Surveillance System (CTBLSS) is an isolate-based laboratory surveillance system and was used to obtain information on the results of drug susceptibility testing (DST) as well as province or territory, sex and age of the individual from which the sample originated. The Canadian Tuberculosis Reporting System (CTBRS) is a case-based surveillance system with information on active and retreatment TB cases in Canada and was used to derive origin data, which is defined as either foreign-born, Canadian-born Indigenous or Canadian-born non-Indigenous. Analysis was descriptive and compared with data from these two sources for 2007-2016. RESULTS: In 2017, 1,515 TB isolates were tested for resistance to anti-TB drugs, with 123 (8.1%) demonstrating resistance to any first-line anti-TB drug. Of these, 103 were monoresistant, six were polyresistant and 14 were multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB). No extensively drug-resistant tuberculosis (XDR-TB) isolates were reported. Drug resistance was reported in seven provinces/territories (British Columbia, Alberta, Saskatchewan, Manitoba, Ontario, Quebec and New Brunswick). There were 63 isolates from females with drug resistance (9.5%) and 60 isolates from males with drug resistance (7.0%). Drug resistance was found in a greater percentage of isolates among those aged 25-34 (n=29, 23.6%). By origin, 1,072 (11%) foreign-born TB cases reported between 2005 and 2015 were drug-resistant. Among the Canadian-born non-Indigenous and Canadian-born Indigenous TB cases, 143 (9%) and 54 (2%) were drug-resistant, respectively. Compared with previous years, the number of isolates tested increased slightly (from 1,267 to 1,515); however, there was a decrease in the percentage of isolates with reported drug resistance (from 10.5% in 2007 to 8.1% in 2017). CONCLUSION: In 2017, TB drug resistance rates remained low in Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».