Evaluation of a validated methylation triage signature for human papillomavirus positive women in the HPV FOCAL cervical cancer screening trial
Notice bibliographique
Résumé
Human papillomavirus (HPV)-based cervical cancer screening requires triage of HPV positive women to identify those at risk of cervical intraepithelial neoplasia grade 2 (CIN2) or worse. We conducted a blinded case-control study within the HPV FOCAL randomized cervical cancer screening trial of women aged 25-65 to examine whether baseline methylation testing using the S5 classifier provided triage performance similar to an algorithm relying on cytology and HPV genotyping. Groups were randomly selected from women with known HPV/cytology results and pathology outcomes. Group 1: 104 HPV positive (HPV+), abnormal cytology (54 CIN2/3; 50 <CIN2); Group 2: 103 HPV+, normal cytology with HPV persistence at 12 mo. (53 CIN2/3; 50 <CIN2); Group 3: 50 HPV+, normal cytology with HPV clearance at 12 mo. (assumed <CIN2), total n=257. For the combined groups, S5 risk score CIN2/3 relative sensitivity, specificity and positive predictive value (PPV) were compared with other triage approaches. Methylation showed a highly significant increasing trend with disease severity. For CIN3, S5 relative sensitivity and specificity were: 93.2% (95%CI: 81.4-98.0) and 41.8% (35.2-48.8), compared to 86.4% (75.0-95.7) and 49.8% (43.1-56.6) respectively for combined abnormal cytology/HPV16/18 positivity (differences not statistically significant at 5% level); adjusted PPVs were 18.2% (16.2-20.4) and 19.3% (16.6-22.2) respectively. S5 was also positive in baseline specimens from eight cancers detected during or after trial participation. The S5 methylation score had high sensitivity and PPV for CIN3, compatible with US and European thresholds for colposcopy referral. Methylation signatures can identify most HPV positive women at increased risk of cervical cancer from their baseline screening specimens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».