Combination of transcriptome sequencing and iTRAQ proteome reveals the molecular mechanisms determining petal shape in herbaceous peony (<i>Paeonia lactiflora</i> Pall.)
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Notice bibliographique
Résumé
The molecular mechanisms controlling petal shape in a herbaceous peony, Paeonia lactiflora Pall., a popular high-grade cut flower worldwide, remain unclear. Here, we selected inner and outer petals from P. lactiflora ‘ZiFengyu’ with an anemone type as the study object. Using transcriptome sequencing and isobaric tags for relative and absolute quantitation proteome, 979 differentially expressed genes and 266 differentially expressed proteins were detected within the inner and outer petals. Of these, the present study identified a key gene APETALA2 that regulates flower shape development. In addition, we obtained a 1935 bp full-length cDNA sequence of APETALA2 by rapid amplification of cDNA ends amplification. Through further validation using quantitative real-time polymerase chain reaction and Western blot analysis, APETALA2 showed a markedly higher expression in outer than that in inner petals. Therefore, the present study indicates that the increased expression of APETALA2 contributes to the formation of petals in P. lactiflora.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle