Data relating to the transcriptomes of human lung epithelial cells exposed to radon-emitting rock, tobacco smoke or cannabis smoke
Notice bibliographique
Résumé
Presented herein are RNA expression data linked to the exposure of human lung epithelial cells to either low dose radon-emitting rock, tobacco smoke or cannabis smoke. Two cell lines were used, one representing a ‘normal’ lung epithelial cell (BEAS-2B, derived from immortilized bronchial epithelial cells from a cadaver) and one representing a ‘cancerous’ lung epithelial cell (NCI-H1975, derived from a primary lung adenocarcinoma from a non-smoker). Control cells were cultured under standard conditions. Test cells were either (a) continuously cultured in the presence of pulverized uranium-containing rock emitting 38 Bq/m3 radon, or (b) exposed five days a week, to a 1:10,000 dilution of either tobacco or cannabis smoke from one cigarette. RNA was extracted from the cells at various time-points over a period of 1–17 weeks (7–140 days). cDNA libraries were prepared from the RNA, and the libraries were sequenced. Raw, aligned sequencing data, from 38 biosamples, are available through a public repository. Differential gene expression data, relating to control and test samples from various time-points, are linked to this article. Detailed analyses relating to these data can be found in the article “Human lung epithelial cells cultured in the presence of radon-emitting rock experience gene expression changes similar to those associated with tobacco smoke exposure” [1].
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».