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Enregistrement W2899883991 · doi:10.1093/neuonc/noy148.844

PDTM-02. STRESS GRANULES ARE INDUCED BY OXIDATIVE STRESS IN PEDIATRIC BRAIN TUMORS AND PREDICT POOR OUTCOME

2018· article· en· W2899883991 sur OpenAlexaff
Alberto Delaidelli, Gian Luca Negri, Brian Cho, Sean W. Minaker, Amal M. El-Naggar, Juliette Hukin, Stephen Yip, Mariarita Santi, John M. Maris, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThermal Regulation in Medicine
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOxidative stressImmunohistochemistryStress granuleRNA-binding proteinTissue microarrayCancer researchBiologyMedicinePediatric cancerPathologyInternal medicineCancerMessenger RNATranslation (biology)Gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/OBJECTIVES: Brain tumors represent the most common and aggressive pediatric cancer type, underscoring a dire need for novel therapeutic approaches. Tumors are continually exposed to acute changes in their microenvironment, including oxidative stress. To overcome acute stress, cells form stress granules (SGs), clusters of RNA and RNA-binding proteins (RBPs) that rapidly alter the cellular mRNA translation landscape. Preliminary data indicate that pharmacological inhibition of SG formation blocks the antioxidant response of the transcription factor NRF2 (NFE2L2), impairing pediatric sarcoma invasive and metastatic capacity. We therefore set out to determine if pediatric brain tumors rely on SGs to overcome oxidative stress, and if targeting SGs could represent a therapeutic approach for these tumors. We analyzed public databases for links between mRNA expression of the RBP G3BP1 and NFE2L2. Immunohistochemistry (IHC) for G3BP1, NRF2 and oxidative stress markers (4HNE) was performed on atypical theratoid rabdoid tumor (AT/RT), pediatric glioblastoma (pGBM) and ependymoma (EPN) tissue microarrays. AT/RT, pGBM and EPN cell lines were treated with NaAsO2 and H2O2 to induce oxidative stress and SG presence was determined by ImmunoFluorescence for the RBPs G3BP1 and TIA-1. G3BP1 and NFE2L2 expression positively correlates in several pediatric tumor cohorts, including AT/RT, pGBM and EPN (p<0.01). IHC not only confirmed mRNA results, but revealed that G3BP1 over-expression is linked to higher WHO grade and recurrent disease in EPN. High G3BP1 levels are also predictive of poor outcome in pGBM (p<0.05). Finally, oxidative stress induces the RBPs G3BP1 and TIA-1 to form SGs in vitro. CONCLUSIONS: SGs represent an important mediator for the adaptive response of pediatric brain tumors to acute oxidative stress. Inhibiting SG formation might therefore constitute a therapeutic approach for AT/RT, pGBM and EPN. Future studies will aim at confirming the efficacy of drugs that inhibit SG formation in pediatric brain tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,105
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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