PDTM-12. DLX2 TRANSCRIPTIONAL REGULATION OF CENTRAL NERVOUS SYSTEM CELL FATE RELEVANCE TO PEDIATRIC DIFFUSE MIDLINE GLIOMAS WITH HISTONE 3 MUTATIONS
Notice bibliographique
Résumé
Diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG) is refractory to current therapy with less than 2% long term survivors. The identification of histone H3.1/H3.3 K27M mutations in most DIPG has provided new insights into the biology of this fatal disease. The DLX homeobox genes are expressed in the developing forebrain. The Dlx1/Dlx2 double knockout (DKO) mouse loses tangential GABAergic interneuron migration to the neocortex. We have identified genes that encode glutamic acid decarboxylase (GAD) enzymes as direct transcriptional targets of DLX1/DLX2. In DIPG patients with H3.3 K27M mutations there is decreased Dlx2 and increased expression of the myelin transcription factor, Myt1. There is loss of H3 K27 tri-methylation (me3) expression in many tumors with K27M mutations. METHODS AND We used bioinformatics approaches and chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays to identify Olig2, Nkx2.2 and Myt1 promoter sequences as candidate DLX2 targets in vivo. DNA binding specificity was confirmed by gel shift assays in vitro. The functional consequences of Dlx2 co-expression with reporter constructs of ChIP-isolated promoter fragments of Olig2 and Nkx2.2 demonstrated repression of gene targets in vitro. qPCR showed increased Olig2 and Nkx2.2 expression in the DKO forebrain. Stable transfection of Dlx2 into a murine DIPG (mDIPG) cell line with the K27M mutation resulted in increased expression of Gad1 and Gad2 and decreased expression of Olig2 and Nkx2.2. Dlx2 stable transfection also resulted in decreased migration, invasion and colony number and size in vitro. Of significance, we demonstrated decreased expression of H3.3 K27M and restoration of H3.3 K27me3 expression in Dlx2 stable transfected mDIPG cells. CONCLUSIONS: DLX transcription factors promote GABAergic interneuron and concomitant inhibition of oligodendroglial differentiation in neural progenitors by repression of a suite of genes including Olig2 and Nkx2.2. Restoration of H3 K27me3 expression in DIPG provides a promising lead towards exploration of differentiation as a therapeutic strategy for DIPG.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».