MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2899933443 · doi:10.2172/1416896

The dual effect of tubulin manipulation on Populus wood formation and drought tolerance

2017· report· en· W2899933443 sur OpenAlexaff
Chung‐Jui Tsai, Scott A. Harding, Michael G. Hahn, Gary F. Peter, Shawn D. Mansfield

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typereport
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXylemTubulinTransgeneHemicelluloseMicrotubuleLigninCell wallSecondary cell wallCell biologyBiologyMicrofibrilBotanyCelluloseBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The main objectives were to generate transgenic Populus with altered alpha- (TUA) and beta-tubulin (TUB) expression and/or post-translational modifications (PTMs) in a plant-wide, guard cell-specific or xylem-specific manner, and then to characterize the effects of the modifications on tree growth and wood properties. In short, strong effects on cell wall composition were noted in leaves where transgene expression was strong (Harding et al. 2017; Hu et al. in review). Subtle, but noteworthy effects were observed in wood (developing xylem) where transgene expression was weak (Swamy et al. 2015). Any effect of PTM manipulation was functionally recessive and/or confounded by tubulin overexpression. It was anticipated that PTM manipulation would affect tubulin half-life, and this is the question that was being addressed, but overall tubulin protein levels correlated with transgene expression levels. We also demonstrated that a dynamic C-terminal PTM known as the tyrosination/detyrosination cycle, so common in animal systems, and purportedly operational in plants, does not occur in wood-forming tissues of Populus (Hu et al. 2016). Contrary to the commonly hypothesized role of microtubules in directing microfibril deposition, cellulose content and microfibril angle were not changed in tubulin-overexpressing plants, nor were hemicellulose and lignin contents, in either wood or leaves. Instead, this project demonstrated that the extractability of pectin and xylan polysaccharides was sensitive to tubulin perturbations, with consequences in stomatal stress response and lignocellulosic biomass utilization. The work also revealed a complex interplay by multi-compartmental (cell wall and cytoskeleton) signaling that impinged upon the control of phenylpropanoid metabolic flux to modulate stomatal response to environmental stimuli.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetPlant Gene Expression AnalysisTravaux en français237 207