MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2899975841 · doi:10.4049/jimmunol.198.supp.148.15

The <i>Lactobacillus rhamnosus</i> R0011 secretome attenuates TNFα-induced pro-inflammatory gene expression in human HT-29 intestinal epithelial cells

2017· article· en· W2899975841 sur OpenAlexaff
Michael Jeffrey, Chad W. MacPherson, Olivier Mathieu, Thomas A. Tompkins, Julia M. Green-Johnson

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensLallemand (Canada)Ontario Tech University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLactobacillus rhamnosusGene expressionTumor necrosis factor alphaChemokineBiologyMolecular biologyMicrobiologyLactobacillus caseiInnate immune systemImmune systemChemistryCell biologyLactobacillusImmunologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Probiotic lactic acid bacteria have been associated with a wide array of host-immune modulatory effects including modulation of pro-inflammatory gene expression. However, many questions remain about the exact cellular mechanisms through which these bacteria modulate host cell responses following pro-inflammatory challenge. The aim of this study was to elucidate the effects of the Lactobacillus rhamnosus R0011 secretome on TNFα-induced pro-inflammatory gene expression. Previous analysis has shown that the <10kDa fraction of the Lr R0011 secretome attenuates TNFα-induced IL-8 production from HT-29 intestinal epithelial cells (IECs). Whole-genome wide microarray analysis was used to further interrogate the impact of the <10kDa fraction of the Lr R0011 secretome on TNFα-induced gene expression. Contact with the <10kDa secretome fraction alone induced minimal changes in global gene expression by HT-29 IECs, with no increases in pro-inflammatory gene expression. However, the <10kDa fraction of the Lr R0011 secretome attenuated TNFα-induced expression of the pro-inflammatory mediators CCL10, CXCL1, CXCL10, CXCL11, IL-1β, IL-8, IL-17C, IL-23A, IL-32, and PTGS2, when compared to HT-29 IEC treated with TNFα alone. Co-challenge of HT-29 IECs with the <10kDa fraction of the Lr R0011 secretome and TNFα also resulted in an increase in the expression of dual specificity phosphatase 1 (DUSP1), a key regulator of the MAPK pathway, and of activating transcription factor 3 (ATF3), a negative regulator of innate immunity, relative to HT-29 IECs treated with TNFα alone. This provides insight into mechanisms through which these bacteria may influence innate immune activity at the IEC level through soluble mediators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Immunology→Même sujetProbiotics and Fermented Foods→Travaux en français237 207→