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Enregistrement W2900293370 · doi:10.3389/fmicb.2018.02662

Plant Litter Type Dictates Microbial Communities Responsible for Greenhouse Gas Production in Amended Lake Sediments

2018· article· en· W2900293370 sur OpenAlexaff
Kurt M. Yakimovich, Erik J. S. Emilson, Michael A. Carson, Andrew J. Tanentzap, Nathan Basiliko, Nadia Mykytczuk

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensNatural Resources CanadaLaurentian University
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilSight Research UK
Mots-clésMethanogenMicrobial population biologyDominance (genetics)BiologyEcologyMethanogenesisBotanyEnvironmental scienceBacteriaMethane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microbial communities of lake sediments play key roles in carbon cycling, linking lakes to their surrounding landscapes and to the global climate system as incubators of terrestrial organic matter and emitters of greenhouse gases, respectively. Here, we amended lake sediments with three different plant leaf litters: a coniferous forest mix, deciduous forest mix, cattails (Typha latifolia) and then examined the bacterial, fungal and methanogen community profiles and abundances. Polyphenol were found to correlate with changes in the bacterial, methanogen, and fungal communities; most notably dominance of fungi over bacteria as polyphenol levels increased with higher abundance of the white rot fungi Phlebia spp. Additionally, we saw a shift in the dominant orders of fermentative bacteria with increasing polyphenol levels, and differences in the dominant methanogen groups, with high CH4 production being more strongly associated with generalist groups of methanogens found at lower polyphenol levels. Our present study provides insights into, and basis for future study on how shifting upland and wetland plant communities may influence anaerobic microbial communities and processes in lake sediments, and may alter the fate of terrestrial carbon entering inland waters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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