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Enregistrement W2900314805 · doi:10.1101/466086

Heterogeneity of Incipient Atrophy Patterns in Parkinson’s Disease

2018· preprint· en· W2900314805 sur OpenAlexaff
Pedro D. Maia, Sneha Pandya, Justin Torok, Ajay Gupta, Yashar Zeighami, Ashish Raj

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésAtrophySubstantia nigraParkinson's diseaseNeuroscienceDiseaseBasal gangliaAmygdalaPathologyPsychologyMedicineCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Parkinson’s Disease (PD) is a the second most common neurodegenerative disorder after Alzheimer’s disease and is characterized by cell death in the amygdala and in substructures of the basal ganglia such as the substantia nigra. Since neuronal loss in PD leads to measurable atrophy patterns in the brain, there is clinical value in understanding where exactly the pathology emerges in each patient and how incipient atrophy relates to the future spread of disease. A recent seed-inference algorithm combining an established network-diffusion model with an L1-penalized optimization routine led to new insights regarding the non-stereotypical origins of Alzheimer’s pathologies across individual subjects. Here, we leverage the same technique to PD patients, demonstrating that the high variability in their atrophy patterns also translates into heterogeneous seed locations. Our individualized seeds are significantly more predictive of future atrophy than a single seed placed at the substantia nigra or the amygdala. We also found a clear distinction in seeding patterns between two PD subgroups – one characterized by predominant involvement of brainstem and ventral nuclei, and the other by more widespread frontal and striatal cortices. This might be indicative of two distinct etiological mechanisms operative in PD. Ultimately, our methods demonstrate that the early stages of the disease may exhibit incipient atrophy patterns that are more complex and variable than generally appreciated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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