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Enregistrement W2900387472 · doi:10.1093/neuonc/noy148.172

CSIG-06. THE MOLECULAR SUBTYPE OF PRIMARY GLIOBLASTOMA CELLS CORRELATES WITH RESPONSE TO THERAPEUTIC AGENTS THAT INDUCE APOPTOSIS OR SENESCENCE

2018· article· en· W2900387472 sur OpenAlexaff
Ritesh Kumar, Ian A.J. Lorimer

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAngiogenesis and VEGF in Cancer
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSenescenceGlioblastomaApoptosisCancer researchPrimary (astronomy)Cellular senescenceBiologyCell biologyGeneticsGenePhenotypePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Glioblastoma (GBM) is the most common adult primary brain tumour. Despite maximal therapy, median survival is 14 months. Resistance to therapy in GBM is due to extensive molecular heterogeneity. Gene expression profiling demonstrates four major subtypes: proneural, neural, classical, and mesenchymal. Recently it was shown that the mesenchymal subtype of GBM cells are resistant to ionizing radiation induced apoptosis. However, the response of other subtypes to therapy with respect to apoptosis or senescence (irreversible growth arrest) remains unknown. Further investigation into the susceptibility of the molecular subtypes and mechanisms responsible for resistance may yield insight into novel therapeutic targets. Primary Glioblastoma (PriGO) cells were harvested from 3 human patients with GBM and cultured in serum free media. Microarray analysis was used to determine the predominant molecular subtype of each cell line. Cells were then treated with radiation, chemotherapy, or serum (an agent known to induce senescence in PriGO cells). Apoptosis was measured by cell counts, caspase-3 activation, and Annexin-V positivity. Senescence was determined by SA-β-Gal assay, markers of cell cycle arrest (p21) and heterochromatin formation (PML bodies). PriGO8A and PriGO9A cells were predominantly classical whereas PriGO17A cells were predominantly mesenchymal. Classical PriGO8A and PriGO9A cells underwent apoptosis in response to radiation and the chemotherapeutic agent Triapine but underwent senescence in response to serum. Mesenchymal PriGO17A cells failed to undergo apoptosis or senescence in response to any agent. Inhibition of a key hyperactive pathway in mesenchymal cells, the Ras pathway, led to an increase in senescence induction. The molecular subtype of GBM correlates with response to therapy. The classical subtype is sensitive to agents that induce apoptosis and senescence whereas the mesenchymal subtype is resistant. Resistance to therapy may be mediated by the Ras pathway and its inhibition may render such cells susceptible to senescence inducing agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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