CSIG-06. THE MOLECULAR SUBTYPE OF PRIMARY GLIOBLASTOMA CELLS CORRELATES WITH RESPONSE TO THERAPEUTIC AGENTS THAT INDUCE APOPTOSIS OR SENESCENCE
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Glioblastoma (GBM) is the most common adult primary brain tumour. Despite maximal therapy, median survival is 14 months. Resistance to therapy in GBM is due to extensive molecular heterogeneity. Gene expression profiling demonstrates four major subtypes: proneural, neural, classical, and mesenchymal. Recently it was shown that the mesenchymal subtype of GBM cells are resistant to ionizing radiation induced apoptosis. However, the response of other subtypes to therapy with respect to apoptosis or senescence (irreversible growth arrest) remains unknown. Further investigation into the susceptibility of the molecular subtypes and mechanisms responsible for resistance may yield insight into novel therapeutic targets. Primary Glioblastoma (PriGO) cells were harvested from 3 human patients with GBM and cultured in serum free media. Microarray analysis was used to determine the predominant molecular subtype of each cell line. Cells were then treated with radiation, chemotherapy, or serum (an agent known to induce senescence in PriGO cells). Apoptosis was measured by cell counts, caspase-3 activation, and Annexin-V positivity. Senescence was determined by SA-β-Gal assay, markers of cell cycle arrest (p21) and heterochromatin formation (PML bodies). PriGO8A and PriGO9A cells were predominantly classical whereas PriGO17A cells were predominantly mesenchymal. Classical PriGO8A and PriGO9A cells underwent apoptosis in response to radiation and the chemotherapeutic agent Triapine but underwent senescence in response to serum. Mesenchymal PriGO17A cells failed to undergo apoptosis or senescence in response to any agent. Inhibition of a key hyperactive pathway in mesenchymal cells, the Ras pathway, led to an increase in senescence induction. The molecular subtype of GBM correlates with response to therapy. The classical subtype is sensitive to agents that induce apoptosis and senescence whereas the mesenchymal subtype is resistant. Resistance to therapy may be mediated by the Ras pathway and its inhibition may render such cells susceptible to senescence inducing agents.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».