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Enregistrement W2900450269 · doi:10.3389/fmicb.2018.02674

Transducer-Like Protein in Campylobacter jejuni With a Role in Mediating Chemotaxis to Iron and Phosphate

2018· article· en· W2900450269 sur OpenAlexaff
Kshipra Chandrashekhar, Vishal Srivastava, Sunyoung Hwang, Byeonghwa Jeon, Sangryeol Ryu, Gireesh Rajashekara

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesIndian Council of Agricultural Research
Mots-clésChemotaxisCampylobacter jejuniBiologyMicrobiologyMutantMotilitylac operonVirulenceGeneBacteriaCell biologyPlasmidGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemotaxis-mediated motility enables Campylobacter jejuni to navigate through complex environmental gradients and colonize diverse niches. C. jejuni is known to possess several methyl accepting chemotaxis proteins (MCPs), also called transducer-like proteins (Tlps). While the role of some of the Tlps in chemotaxis has been identified, their regulation and role in virulence is still not very clear. Here, we investigated the contribution of Tlp2 to C. jejuni chemotaxis, stress survival and colonization of the chicken gastrointestinal tract. The Δtlp2 deletion mutant showed decreased chemotaxis towards aspartate, pyruvate, inorganic phosphate (Pi) and iron (FeSO4). Transcriptional analysis of tlp2 with a promoter fusion reporter assay revealed that the tlp2 promoter (Ptlp2) was induced by Pi and iron, both in the ferrous (Fe2+) and ferric form (Fe3+). RT-PCR analysis using overlapping primers indicated that the phoX gene, located immediately downstream of tlp2, is co-transcribed with tlp2. A transcription start site was identified at 53 bp upstream of the tlp2 start codon. The Δtlp2 mutant showed decreased colonization of the chicken gastrointestinal tracts. Collectively, our findings described tlp2 plays a role in C. jejuni pathogenesis and colonization in the chicken host and its expression is regulated by iron.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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