Development of a multiplex real‐time PCR for simultaneous detection of <scp><i>Bacillus cereus</i></scp>, <scp><i>Listeria monocytogenes</i></scp>, and <scp><i>Staphylococcus aureus</i></scp> in food samples
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Bacillus cereus, Listeria monocytogenes, and Staphylococcus aureus caused problems in public health and food safety. A multiplex real‐time PCR (qPCR) for simultaneous detection of these three pathogens in different kinds of food was developed. A high specificity (100%) was obtained using 21 target strains and 19 nontarget strains. Standard curves for pure cultures covered seven orders of magnitude (from 108 to 102 cfu/ml) with high amplification efficiencies ranging from 94.2 to 105.4% with R‐squares over 0.999. When multiplex qPCR was applied for artificially contaminated cherry tomato, milk, and spam samples, a detection limit of 103 cfu/g or ml was obtained for these three bacteria. When low levels (0.4–5.5 cfu/25 g or ml) of bacteria were inoculated in three kinds of food samples and cultured in tryptic soy broth for 24 hr, results obtained from multiplex real‐time and conventional culture methods were not significantly different for all three food matrices based on Mantel–Haenszel chi‐square test. Only for B. cereus in milk, positive portions detected by qPCR were significantly higher than those detected by culture method. Hence, the multiplex qPCR developed in this study is highly specific and effective for simultaneous detection B. cereus, L. monocytogenes, and S. aureus in food samples. Practical applications Bacillus cereus, Listeria monocytogenes, and Staphylococcus aureus are three major foodborne pathogens and have been found in a wide range of foods. We developed a multiplex qPCR specific targeting groEL, iap, and nuc genes with a high amplification efficiency. Different food samples (cherry tomato, milk, and spam) were tested for evaluating the performance of the multiplex qPCR. The detection results by qPCR were compared with the conventional culture methods and no significant differences were found using Mantel–Haenszel chi‐square test. This study provides the information of the developed multiplex qPCR for detecting three specific foodborne pathogens and applications in food samples, which will be helpful for further studies about simultaneous detection of several targets in food samples using multiplex PCR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».