MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2900567198 · doi:10.1089/mdr.2018.0341

Antimicrobial Susceptibility and Clonal Relationship of Tetracycline Resistance Genes in <i>netF</i> -Positive <i>Clostridium perfringens</i>

2018· article· en· W2900567198 sur OpenAlexafffundabout
Iman Mehdizadeh Gohari, Patrick Boerlin, John F. Prescott

Notice bibliographique

RevueMicrobial Drug Resistance · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesUniversity of Guelph
Mots-clésMicrobiologyClostridium perfringensBiologyClindamycinTetracyclineBroth microdilutionAmpicillinMultilocus sequence typingPenicillinAntibiotic resistanceAntimicrobialVirologyAntibioticsGeneGenotypeGeneticsBacteriaMinimum inhibitory concentration

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NetF-producing type A Clostridium perfringens , a pathotype of C. perfringens , causes necrotizing enteritis in neonatal foals and necrotizing and hemorrhagic enteritis in dogs. Recent core genome multilocus sequence typing study revealed that netF + C. perfringens strains belong to two distinct clonal populations (clonal complexes I and II). There are no reports on susceptibility to antimicrobial drugs of isolates from this pathotype. The susceptibility to 13 different antimicrobial drugs of 49 netF + strains recovered from foals or dogs with necrotizing enteritis in Canada, the United States, and Switzerland was assessed using a commercial microdilution panel designed for anaerobic human pathogens. All isolates were highly susceptible to 12 antimicrobial agents, including all beta-lactams tested, such as penicillin G and ampicillin, as well as clindamycin, chloramphenicol, and metronidazole. The isolates consistently presented a reduced susceptibility or resistance to tetracycline, which was associated with previously described tetracycline resistance genes. Clonal complex I isolates ( n = 41) possessed the tetA408 (P) gene, whereas clonal complex II isolates ( n = 8) possessed the tetA (P)- tetB (P) genes and were more likely to be fully resistant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobial Drug ResistanceMême sujetClostridium difficile and Clostridium perfringens researchTravaux en français237 207