Different pre-implantation phenotypes of bovine blastocysts produced <i>in vitro</i>
Notice bibliographique
Résumé
Embryo transfer in cattle is performed with blastocysts produced in vivo or in vitro using defined media. However, outdated systems such as those that use serum and co-culture remain of interest for research purposes. Here, we investigated the effect of additional culture time on in vitro-produced embryos. Specifically, we compared embryos that formed a blastocoel at different times after fertilisation to those that stayed in culture for up to two additional days with respect to their development in vivo after temporary transfer to oestrus-synchronised recipients. A pre-transfer set (D6, D6+1, D6+2, D7, D7+1, D8) was examined using microarray analyses and correlated with a post-transfer set that included two different days of transfer (D6-T6, D6+2-T8, D7+1-T8, D8-T8). All surviving conceptuses reached primitive-streak stages and filamentous sizes similarly to in vivo (D18) or in vitro controls (D7/T7). The recovery rate differed between D6 and D8 embryos that were immediately transferred (58 vs 25%). With an intermediate survival rate (33%), the D6 embryos with two additional days in culture produced nine times more IFN-tau (IFNT) at D18 than the D6 embryos that were immediately transferred. At the end of culture, D6 and D6+2 embryos displayed the highest number of gene expression differences. Despite a mortality of 40–60%, no signature was detectable in any of the transferred groups that would account for the embryos’ fates. Initially reputed to be beneficial in producing more blastocysts, our culture system of B2 medium plus serum and co-culture generated blastocysts that were distinct from those developed in vivo (D7).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».