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Enregistrement W2900676236 · doi:10.1242/jeb.193680

Thin-blooded icefish relocate carbonic anhydrase to gill

2018· article· en· W2900676236 sur OpenAlexaboutno aff
Kathryn Knight

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGillCarbonic anhydraseBicarbonateBiologyChemistryFisheryFish <Actinopterygii>ZoologyAnatomyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Few animals can justifiably be called ‘thin blooded’, but Antarctic icefish genuinely are. They lack the brightly pigmented red blood cells that usually carry oxygen around the body, although the blood is still capable of transporting oxygen to their tissues thanks to the high solubility of the gas in the frigid Antarctic waters. But the fish face another problem. In most bony fish, waste carbon dioxide is carried in the blood to the gills in the form of bicarbonate, where it is converted back into carbon dioxide in red blood cells by an enzyme known as carbonic anhydrase, before it is exhaled. ‘However this strategy is impossible in icefishes, which have lost red blood cells’, says Till Harter from the University of British Columbia, Canada. While there is some evidence that the essential bicarbonate converting protein is harboured somewhere in the gills, the precise location was not clear. Reasoning that it might be might be situated on the inner surface of gill blood vessels, Harter, Colin Brauner and their international team of collaborators began searching for the elusive enzyme in the gills of Champsocephalus gunnari icefish.Although Harter was unable to visit Antarctica himself, he was fortunate that Kristin O'Brien from University of Alaska Fairbanks, USA, and Lisa Crockett from Ohio University, USA, sent C. gunnari that they had caught during the 2015 Antarctic field season. After the fish arrived, he cautiously isolated the outer membrane from the cells lining the inside of the gill blood vessels before bathing it in water saturated with CO2 and measuring how the pH changed – in the hope that any carbonic anhydrase present on the membrane surface may convert the gas into bicarbonate. The pH decreased rapidly, confirming that the enzyme is located on blood vessel cell membranes. And when Jonathan Wilson stained the cell membranes with a series of specialised dyes that could only bind to molecules of carbonic anhydrase, he found one form of the enzyme (carbonic anhydrase 4) attached to the membranes lining the inner surface of the gill blood vessels. To confirm the presence of the enzyme, Harter and David Metzger then collected RNA from the fish's gills, eventually identifying an mRNA molecule that could be translated to produce the carbonic anhydrase 4 enzyme. However, when the team searched for carbonic anhydrase proteins in the gills of a close relative, Notothenia rossii, which has retained its red blood cells despite sharing C. gunnari’s icy waters, they found none.So, it seems that icefish have relocated carbonic anhydrase to their gills to overcome the difficulties of carbon dioxide disposal after trading in their red blood cells. But they suspect that red-blooded fish are unlikely to follow their apparently ‘bloodless’ cousin's convenient example, as the enzyme could drastically disturb the delicate balance that allows their red blood cells to keep hold of their oxygen cargo when exercising hard.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
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