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Enregistrement W2900697142 · doi:10.3389/fcimb.2018.00414

Potential Pandemic of H7N9 Avian Influenza A Virus in Human

2018· article· en· W2900697142 sur OpenAlexaff
Zhiqing Pu, Dan Xiang, Xiaobing Li, Tingting Luo, Xuejuan Shen, Robert W. Murphy, Ming Liao, Yongyi Shen

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesChina Agricultural UniversitySouth China Agricultural UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyInfluenza A virus subtype H5N1VirologyPandemicVirusAmino acidAdaptation (eye)GeneInfluenza A virusGeneticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since 2013, the H7N9 avian influenza A virus (AIV) has caused human infections and to the extent of now surpassing H5N1. This raises an alarm about the potential of H7N9 to become a pandemic problem. Our compilation of the amino acid changes required for AIVs to cross the species-barrier discovers 58 that have very high proportions in both the human- and avian-isolated H7N9 viruses. These changes correspond with sporadic human infections that continue to occur in regions of avian infections. Among the six internal viral genes, amino acid changes do not differ significantly between H9N2 and H7N9, except for V100A in PA, and K526R, D627K, and D701N in PB2. H9N2 AIVs provide internal genes to H7N9. Most of the amino acid changes in H7N9 appear to come directly from H9N2. Seventeen amino acid substitutions appear to have fixed quickly by the 5th wave. Among these, six amino acid sites in HA1 are receptor binding sites, and PB2-A588V was shown to promote the adaptation of AIVs to mammals. The accelerated fixation of mutations may promote the adaptation of H7N9 to human, but need further functional evidence. Although H7N9 AIVs still cannot efficiently transmit between humans, they have the genetic makeup associated with human infections. These viruses must be controlled in poultry to remove the threat of it becoming a human pandemic event.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,526

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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