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Enregistrement W2900795735 · doi:10.1038/s41588-018-0265-y

ROBO4 variants predispose individuals to bicuspid aortic valve and thoracic aortic aneurysm

2018· article· en· W2900795735 sur OpenAlexaff
Russell A. Gould, Hamza Aziz, Courtney E. Woods, Manuel Alejandro Seman-Senderos, Elizabeth Sparks, Christoph Preuß, Florian Wünnemann, Djahida Bedja, Cassandra Rae Moats, Sarah A. McClymont, Rebecca Rose, Nara Sobreira, Hua Ling, Gretchen MacCarrick, Ajay Kumar, Ilse Luyckx, Elyssa Cannaerts, Aline Verstraeten, Hanna Björk, Ann-Cathrin Lehsau, Vinod Jaskula-Ranga, Henrik Lauridsen, Asad A. Shah, Christopher Bennett, Patrick T. Ellinor, Honghuang Lin, Eric M. Isselbacher, Christian L. Lino Cardenas, Jonathan T. Butcher, G. Chad Hughes, Mark E. Lindsay, Luc Mertens, Anders Franco‐Cereceda, Judith M.A. Verhagen, Marja W. Wessels, Salah A. Mohamed, Per Eriksson, Seema Mital, Lut Van Laer, Bart Loeys, Grégor Andelfinger, Andrew S. McCallion, Harry C. Dietz

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenUniversité de MontréalSickKids FoundationCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthLundbeckfondenNational Human Genome Research InstituteEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBicuspid aortic valveThoracic aortic aneurysmBiologyInternal medicineAortic aneurysmCardiologyAortic valveAneurysmAortaRadiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bicuspid aortic valve (BAV) is a common congenital heart defect (population incidence, 1–2%)1–3 that frequently presents with ascending aortic aneurysm (AscAA)4. BAV/AscAA shows autosomal dominant inheritance with incomplete penetrance and male predominance. Causative gene mutations (for example, NOTCH1, SMAD6) are known for ≤1% of nonsyndromic BAV cases with and without AscAA5–8, impeding mechanistic insight and development of therapeutic strategies. Here, we report the identification of variants in ROBO4 (which encodes a factor known to contribute to endothelial performance) that segregate with disease in two families. Targeted sequencing of ROBO4 showed enrichment for rare variants in BAV/AscAA probands compared with controls. Targeted silencing of ROBO4 or mutant ROBO4 expression in endothelial cell lines results in impaired barrier function and a synthetic repertoire suggestive of endothelial-to-mesenchymal transition. This is consistent with BAV/AscAA-associated findings in patients and in animal models deficient for ROBO4. These data identify a novel endothelial etiology for this common human disease phenotype. Individuals with biscuspid aortic valve and ascending aortic aneurysm show enrichment of rare variants in ROBO4. Functional studies suggest that ROBO4 mutations disrupt endothelial cell performance and contribute to pathological remodeling of aortic tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations153
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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