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Enregistrement W2900798344 · doi:10.1109/jbhi.2018.2881086

Secure Similar Patients Query on Encrypted Genomic Data

2018· article· en· W2900798344 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueIEEE Journal of Biomedical and Health Informatics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueCryptography and Data Security
Établissements canadiensUniversity of New BrunswickUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceOutsourcingEncryptionScalabilityCloud computingInformation privacyAdversaryInformation sensitivityFlexibility (engineering)Search engine indexingComputer securityDatabaseInformation retrieval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Both individuals and enterprises produce genomic data rapidly and continuously. There is a need to outsource such data to the cloud for better flexibility. Outsourcing also helps data owners by eliminating the local storage management problem. To protect data privacy and security, data owners must encrypt the sensitive data before outsourcing. Since genomic data are enormous in volume, executing researchers queries securely, and efficiently is a challenging task. In this paper, we introduce an indexing algorithm based on the prefix-tree to support similar patient queries. The proposed method guarantees the following: data privacy, query privacy, and output privacy. The privacy is guaranteed through encryption and garbled circuits considering the semi-honest adversary model. The overall computation is scalable and fast enough for real-life biomedical applications. Moreover, experimental results show that our method performs better than existing state-of-art techniques in this domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,495
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle