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Enregistrement W2900983726 · doi:10.1139/cjpp-2018-0555

What’s in a name? On fibroblast phenotype and nomenclature

2018· review· en· W2900983726 sur OpenAlexafffundvenue
Raghu S. Nagalingam, Danah S. Al‐Hattab, Michael P. Czubryt

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Physiology and Pharmacology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Fibrosis and Remodeling
Établissements canadiensSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchResearch Manitoba
Mots-clésMyofibroblastFibroblastPhenotypeExtracellular matrixBiologyStromal cellCell typeCell biologyPathologyImmunologyCellMedicineCancer researchGeneticsFibrosisCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fibroblasts have long been recognized as important stromal cells, playing key roles in synthesizing and maintaining the extracellular matrix, but historically were treated as a relatively uniform cell type. Studies in recent years have revealed a surprising level of heterogeneity of fibroblasts across tissues, and even within organs such as the skin and heart. This heterogeneity may have functional consequences, including during stress and disease. While the field has moved forward quickly to begin to address the scientific import of this heterogeneity, the descriptive language used for these cells has not kept pace, particularly when considering the phenotype changes that occur as fibroblasts convert to myofibroblasts in response to injury. We discuss here the nature and sources of the heterogeneity of fibroblasts, and review how our understanding of the complexity of the fibroblast to myofibroblast phenotype conversion has changed with increasing scrutiny. We propose that the time is opportune to reevaluate how we name and describe these cells, particularly as they transition to myofibroblasts through discrete stages. A standardized nomenclature is essential to address the confusion that currently exists in the literature as to the usage of terms like myofibroblast and the description of fibroblast phenotype changes in disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,931
Score d'incertitude au seuil0,753

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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