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Enregistrement W2901097982 · doi:10.1161/circulationaha.118.034532

Genome-Wide Association Transethnic Meta-Analyses Identifies Novel Associations Regulating Coagulation Factor VIII and von Willebrand Factor Plasma Levels

2019· review· en· W2901097982 sur OpenAlexaff
Maria Sabater‐Lleal, Jennifer E. Huffman, Paul S. de Vries, Jonathan Marten, Michael A. Mastrangelo, Ci Song, Nathan Pankratz, Cavin Ward‐Caviness, Lisa R. Yanek, Stella Trompet, Graciela E. Delgado, Xiuqing Guo, Traci M. Bartz, Ángel Martínez-Pérez, Marine Germain, Hugoline G. de Haan, Ayse Bilge Ozel, Ozren Polašek, Albert V. Smith, John D. Eicher, Alex P. Reiner, Weihong Tang, Neil M Davies, David J. Stott, Jerome I. Rotter, Geoffrey H. Tofler, Eric Boerwinkle, Moniek P.M. de Maat, Marcus E. Kleber, Paul Welsh, Jennifer A. Brody, Ming‐Huei Chen, Dhananjay Vaidya, José Manuel Soria, Pierre Suchon, Astrid van Hylckama Vlieg, Karl C. Desch, Ivana Kolčić, Peter K. Joshi, Lenore J. Launer, Tamara B. Harris, Harry Campbell, Igor Rudan, Diane M. Becker, Jun Z. Li, Fernando Rivadeneira, André G. Uitterlinden, Albert Hofman, Oscar H. Franco, Mary Cushman, Bruce M. Psaty, Pierre‐Emmanuel Morange, Barbara McKnight, Michael Chong, Israel Fernández‐Cadenas, Jonathan Rosand, Vilmundur Guðnason, James F. Wilson, Caroline Hayward, David Ginsburg, Myriam Fornage, Frits R. Rosendaal, Juan Carlos Souto, Lewis C. Becker, Nancy S. Jenny, Winfried März, J. Wouter Jukema, Abbas Dehghan, David‐Alexandre Trégouët, Alanna C. Morrison, Andrew D. Johnson, Christopher J. O’Donnell, David P. Strachan, Charles J. Lowenstein, Nicholas L. Smith

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensPopulation Health Research InstituteCentre for Global Health Research
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilNational Institute on AgingNational Institutes of HealthEuropean Hematology Association
Mots-clésMendelian randomizationVon Willebrand factorGenome-wide association studyMedicineGenetic associationVon Willebrand diseaseInternal medicineGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGeneImmunologyBioinformaticsGenotypeBiologyPlateletGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Factor VIII (FVIII) and its carrier protein von Willebrand factor (VWF) are associated with risk of arterial and venous thrombosis and with hemorrhagic disorders. We aimed to identify and functionally test novel genetic associations regulating plasma FVIII and VWF. METHODS: We meta-analyzed genome-wide association results from 46 354 individuals of European, African, East Asian, and Hispanic ancestry. All studies performed linear regression analysis using an additive genetic model and associated ≈35 million imputed variants with natural log-transformed phenotype levels. In vitro gene silencing in cultured endothelial cells was performed for candidate genes to provide additional evidence on association and function. Two-sample Mendelian randomization analyses were applied to test the causal role of FVIII and VWF plasma levels on the risk of arterial and venous thrombotic events. RESULTS: ) associations, 7 with FVIII levels ( FCHO2/TMEM171/TNPO1, HLA, SOX17/RP1, LINC00583/NFIB, RAB5C-KAT2A, RPL3/TAB1/SYNGR1, and ARSA) and 11 with VWF levels ( PDHB/PXK/KCTD6, SLC39A8, FCHO2/TMEM171/TNPO1, HLA, GIMAP7/GIMAP4, OR13C5/NIPSNAP, DAB2IP, C2CD4B, RAB5C-KAT2A, TAB1/SYNGR1, and ARSA), beyond 10 previously reported associations with these phenotypes. Functional validation provided further evidence of association for all loci on VWF except ARSA and DAB2IP. Mendelian randomization suggested causal effects of plasma FVIII activity levels on venous thrombosis and coronary artery disease risk and plasma VWF levels on ischemic stroke risk. CONCLUSIONS: The meta-analysis identified 13 novel genetic loci regulating FVIII and VWF plasma levels, 10 of which we validated functionally. We provide some evidence for a causal role of these proteins in thrombotic events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,711
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,276
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,118 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations169
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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