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Enregistrement W2901268111 · doi:10.1021/acssensors.8b00975

Binding-Induced DNA Dissociation Assay for Small Molecules: Sensing Aflatoxin B1

2018· article· en· W2901268111 sur OpenAlexafffund
Lin Xu, Hongquan Zhang, Xiaowen Yan, Hanyong Peng, Zhixin Wang, Qi Zhang, Peiwu Li, Zhaowei Zhang, X. Chris Le

Notice bibliographique

RevueACS Sensors · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchChina Scholarship CouncilCanada Research ChairsAlberta HealthMinistry of Science and Technology of the People's Republic of ChinaAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésFluorophoreChemistryBovine serum albuminDetection limitOligonucleotideFluorescenceAflatoxinQuenching (fluorescence)Colloidal goldBiosensorChromatographyNanoparticleDNABiochemistryMaterials scienceNanotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe a new fluorescence turn-on sensor for homogeneous detection of aflatoxin B1 (AFB1), a potent low molecular weight mycotoxin. A key innovation is the binding-induced intramolecular interaction involving the following two sets of probes: (1) a gold nanoparticle (AuNP) immobilized with hundreds of assistant oligonucleotides (AO) and dozens of anti-AFB1 monoclonal antibodies, and (2) the AFB1-BSA (BSA = bovine serum albumin) antigen conjugated with fluorophore-labeled signal oligonucleotides (SO) that contained a short sequence complementary to AO. Specific binding of AFB1-BSA to the antibody brought the fluorophore very close to the surface of the AuNP through a stable intramolecular hybridization between AO and SO, resulting in efficient quenching of fluorescence. The improved fluorescence quenching substantially reduced the background, due to the binding-induced intramolecular hybridization, and improved the signal-to-background ratio by 390%. In the presence of AFB1 in a sample, competitive binding of AFB1 in the sample to the antibodies immobilized on the AuNP caused the release of the fluorophore-labeled AFB1-BSA from the AuNP, turning on fluorescence. A detection limit of 2.3 nM was achieved, which meets the requirement for AFB1 detection at regulatory levels. Analyses of rice samples using this assay showed recoveries of 86-102%. Incorporating appropriate antibody probes could extend the assay to the detection of other small molecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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