MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2901268166 · doi:10.1038/s41467-018-07345-0

Interethnic analyses of blood pressure loci in populations of East Asian and European descent

2018· article· en· W2901268166 sur OpenAlexaff
Fumihiko Takeuchi, Masato Akiyama, Nana Matoba, Tomohiro Katsuya, Masahiro Nakatochi, Yasuharu Tabara, Akira Narita, Woei‐Yuh Saw, Sanghoon Moon, Cassandra N. Spracklen, Jin Fang Chai, Young‐Jin Kim, Liang Zhang, Chaolong Wang, Huaixing Li, Honglan Li, Jer‐Yuarn Wu, Rajkumar Dorajoo, Jovia L. Nierenberg, Ya Xing Wang, Jing He, Derrick Bennett, Atsushi Takahashi, Yukihide Momozawa, Makoto Hirata, Koichi Matsuda, Hiromi Rakugi, Eitaro Nakashima, Masato Isono, Matsuyuki Shirota, Atsushi Hozawa, Sahoko Ichihara, Tatsuaki Matsubara, Ken Yamamoto, Katsuhiko Kohara, Michiya Igase, Sohee Han, Penny Gordon‐Larsen, Wei Huang, Sang Lee, Linda S. Adair, Mi Yeong Hwang, Juyoung Lee, Miao Li Chee, Charumathi Sabanayagam, Wanting Zhao, Jianjun Liu, Dermot F. Reilly, Liang Sun, Shaofeng Huo, Todd L. Edwards, Jirong Long, Li-Ching Chang, Chien-Hsiun Chen, Jian‐Min Yuan, Woon‐Puay Koh, Yechiel Friedlander, Tanika N. Kelly, Wen Bin Wei, Liang Xu, Hui Cai, Yong‐Bing Xiang, Kuang Lin, Robert Clarke, Robin Walters, Iona Y. Millwood, Liming Li, John C. Chambers, Jaspal S. Kooner, Paul Elliott, Pim van der Harst, Marie Loh, Niek Verweij, Weihua Zhang, Benjamin Lehne, Irene Mateo Leach, Alexander Drong, James Abbott, William R. Scott, Gianluca Campanella, Marc Chadeau‐Hyam, Uzma Afzal, Tõnu Esko, Sarah E. Harris, Jaana Hartiala, Marcus E. Kleber, Richa Saxena, Alexandre F.R. Stewart, Tarunveer S. Ahluwalia, Imke Aits, Alexessander Couto Alves, Shikta Das, Jemma C. Hopewell, Robert W. Koivula, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Iris Postmus, Olli Raitakari, Robert A. Scott, Rossella Sorice, Vinicius Tragante, Michela Traglia, Jon White, Inês Barroso, Andrew Bjonnes, Rory Collins, Gail Davies, Graciela Delgado, Pieter A. Doevendans, Lude Franke, Ron T. Gansevoort, Tanja B. Grammer, Niels Grarup, Jagvir Grewal, Anna‐Liisa Hartikainen, Stanley L. Hazen, Chris Hsu, Lise Lotte N. Husemoen, Johanne Marie Justesen, Meena Kumari, Wolfgang Lieb, David C. Liewald, Evelin Mihailov, Lili Milani, Rebecca Mills, Nina Mononen, Kjell Nikus, Teresa Nutile, Sarah Parish, Olov Rolandsson, Daniela Ruggiero, Cinzia Sala, Harold Snieder, Thomas H. W. Spasø, Wilko Spiering, John M. Starr, David J. Stott, Daniel O. Stram, Silke Szymczak, W.H. Wilson Tang, Stella Trompet, Väinö Turjanmaa, Marja Vääräsmäki, Wiek H. van Gilst, Dirk J. van Veldhuisen, Jorma Viikari, Folkert W. Asselbergs, Marina Ciullo, André Franke, Paul W. Franks, Steve Franks, Myron D. Gross, Torben Hansen, Marjo‐Riitta Järvelin, Torben Jørgensen, J. Wouter Jukema, Mika Kähönen, Mika Kivimäki, Terho Lehtimäki, Allan Linneberg, Oluf Pedersen, Nilesh J. Samani, Daniela Toniolo, Hooman Allayee, Ian J. Deary, Winfried März, Andres Metspalu, Cisca Wijmenga, Bruce H. R. Wolffenbuttel, Paolo Vineis, Soterios Α. Kyrtopoulos, Jos Kleinjans, Mark I. McCarthy, Zhengming Chen, Makoto Sasaki, Xiao‐Ou Shu, Jost B. Jonas, Jiang He, Chew‐Kiat Heng, Yuan-Tsong Chen, Wei Zheng, Lin Xu, Yik‐Ying Teo, E Shyong Tai, Ching‐Yu Cheng, Tien Yin Wong, Xueling Sim, Karen L. Mohlke, Masayuki Yamamoto, Bong-Jo Kim, Tetsuro Miki, Toru Nabika, Mitsuhiro Yokota, Yoichiro Kamatani, Michiaki Kubo, Norihiro Kato

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of OttawaNatural Resources Canada
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchBritish Heart FoundationWellcome Trust
Mots-clésEast AsiaDescent (aeronautics)GeographyBiologyChinaArchaeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blood pressure (BP) is a major risk factor for cardiovascular disease and more than 200 genetic loci associated with BP are known. Here, we perform a multi-stage genome-wide association study for BP (max N = 289,038) principally in East Asians and meta-analysis in East Asians and Europeans. We report 19 new genetic loci and ancestry-specific BP variants, conforming to a common ancestry-specific variant association model. At 10 unique loci, distinct non-rare ancestry-specific variants colocalize within the same linkage disequilibrium block despite the significantly discordant effects for the proxy shared variants between the ethnic groups. The genome-wide transethnic correlation of causal-variant effect-sizes is 0.898 and 0.851 for systolic and diastolic BP, respectively. Some of the ancestry-specific association signals are also influenced by a selective sweep. Our results provide new evidence for the role of common ancestry-specific variants and natural selection in ethnic differences in complex traits such as BP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations129
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207