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Enregistrement W2901434006 · doi:10.1017/s0031182018001907

Genetic and morphometric categorization of<i>Taenia ovis</i>from Sheep in Iran

2018· article· en· W2901434006 sur OpenAlexaff
Sima Rostami, Reza Salavati, Robin N. Beech, Zahra Babaei, Mitra Sharbatkhori, Saeedeh Shamsaddini, Saeid Nasibi, Majid Fasihi Harandi

Notice bibliographique

RevueParasitology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic infections in humans and animals
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOvisBiologyHaplotypePhylogenetic treeBreedVeterinary medicineCladeRibosomal RNAMitochondrial DNAZoologyGenetic variationNucleotide diversityGeneticsGeneGenotypeEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Little is known about the genetic and morphological characters of Taenia ovis. The purpose of the present study was to characterize sheep isolates of T. ovis using rostellar hook morphometry as well as mitochondrial genes sequence analysis. Ninety sheep specimens of Cysticercus ovis were collected from 18 slaughterhouses in Iran. The mean ± s.d. for total length of large and small hooks were 174.1 ± 6.4 and 116.7 ± 5.4 µm, respectively. CO1 and 12S rRNA sequence analysis showed 11 and nine haplotypes, respectively. The level of pairwise nucleotide variations between individual haplotypes of CO1 and 12S rRNA genes were 0.3-1.1 and 0.2-1.0%, respectively. Level of nucleotide variation in CO1 and 12S rRNA between T. ovis haplotypes from present study and eight other Taenia species was found to be 11.3-17.8 and 5.3-16.3%, respectively. Phylogenetic analysis clustered all T. ovis isolates into a single clade comprised of the all CO1 and 12S rRNA haplotypes. CO1 nucleotide difference between T. ovis ovis and T. asiatica was 13.6% that is lesser than the corresponding difference between T. ovis ovis and T. ovis krabbei, warranting the designation of two separate species as T. ovis and T. krabbei. Interclass correlation coefficients showed that there was no significant association between rostellar hook length variation and the variability of the mitochondrial genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,341

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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