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Enregistrement W2901681459 · doi:10.1016/j.bbmt.2018.11.007

Comprehensive B Cell Phenotyping Profile for Chronic Graft-versus-Host Disease Diagnosis

2018· article· en· W2901681459 sur OpenAlexafffund
Jacob Rozmus, Amina Kariminia, Sayeh Abdossamadi, Barry E. Storer, Paul J. Martin, Stephanie J. Lee, Daniel Wolff, Mukta Arora, Corey Cutler, Kirk R. Schultz

Notice bibliographique

RevueBiology of Blood and Marrow Transplantation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHematopoietic Stem Cell Transplantation
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésB-cell activating factorMedicineFlow cytometryBiomarkerB cellImmunologyCohortPopulationCellCD19Internal medicineOncologyAntibodyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have reported single B cell-related chronic graft-versus-host disease diagnostic (cGVHD) biomarkers, such as B cell-activating factor (BAFF), CD21 low , and immature B cells, but research on the performance of biomarker combinations and the covariate effect of steroids is lacking. The primary objective of this study was to determine the most accurate combination of B cell populations using cell surface staining flow cytometry in an independent cohort of patients with cGVHD. Secondary objectives included assessing the effect of corticosteroid use at sample collection on the makeup and accuracy of the diagnostic panel and identifying the mechanism underlying low surface expression of BAFF receptor (BAFF-R) on B cells in cGVHD. Flow cytometry analysis was performed in an adult cohort of post-HCT patients with cGVHD onset (n = 44) and time-matched recipients without cGVHD (n = 63). We confirmed that the onset of cGVHD was associated with higher soluble BAFF (sBAFF) levels, elevated CD27 − CD10 − CD21 low CD19 + B cell and classical switched memory B cell counts, and reduced transitional and naïve B cell counts. The highest single B cell population area under the receiver operating characteristic (ROC) curve (AUC) was .72 for transitional type 1 CD21 low B cells. We also showed a significant inverse relationship between sBAFF and surface BAFF-R expression caused by sBAFF modulation of BAFF-R. Steroid use at sample collection influenced the significance of the sBAFF:B cell ratio, naïve and marginal zone-like B cells. The optimal combination of B cell subsets most significantly associated with cGVHD onset with or without concurrent corticosteroid use resulted in ROC AUCs of .87 and .84, respectively. Transitional and CD21 low B cells were the only populations present in both panels; however, analyzing only these populations resulted in ROC AUCs of .79 and .78, respectively. This suggests that the inclusion of other populations and use of different panels depending on steroid use is necessary to achieve better accuracy. sBAFF was not a component of either panel. These novel B cell profiles could be tested prospectively in patients post-HSCT and could lead to focused mechanistic studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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