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Enregistrement W2901803246 · doi:10.1101/470229

The double tubular contractile structure of the type VI secretion system displays striking flexibility and elasticity

2018· preprint· en· W2901803246 sur OpenAlexafffund
María Silvina Stietz, Xiaoye Liang, Megan J. Q. Wong, Steven J. Hersch, Tao Dong

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésType VI secretion systemContraction (grammar)BiophysicsChemistryCytoplasmBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The double tubular structure of the type VI secretion system (T6SS) is considered as one of the longest straight and rigid intracellular structures in bacterial cells. Contraction of the T6SS outer sheath occurs almost instantly and releases sufficient power to inject the inner needle-like Hcp tube and its associated effectors into target bacterial cells through piercing the stiff cell envelope. The molecular mechanism triggering T6SS contraction remains elusive. Here we report that the double tubular T6SS structure is strikingly flexible and elastic, forming U-, circular-, or S-shapes while maintaining functional for contraction and substrate delivery. We show that physical contact with cytoplasmic membrane induced a range of T6SS structure deformation, but the resultant mechanical pressing force on the T6SS baseplate did not trigger contraction. Our results also reveal a stalling intermediate stage of sheath-tube extension following which the structure contracts or resumes to extend. These observations suggest that the recruitment equilibrium of sheath-tube precursors to the extending structure is key to stability/contraction and lead us to propose a model of T6SS contraction, termed ESCAPE (extension-stall-contraction and precursor equilibrium). Our data highlight the remarkable flexibility of the double tubular T6SS structure and its length control mechanism distinct from the other evolutionarily related contractile cell-puncturing systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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