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Enregistrement W2901845799 · doi:10.1152/jn.00265.2018

Neuromuscular junction abnormalities in a zebrafish loss-of-function model of TDP-43

2018· article· en· W2901845799 sur OpenAlexafffund
Poulomee Bose, Gary A.B. Armstrong, Pierre Drapeau

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurophysiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMitacs
Mots-clésZebrafishNeuromuscular junctionNeuroscienceFunction (biology)BiologyChemistryCommunicationAnatomyPsychologyCell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Almost 90% of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) cases are characterized by the presence of aggregates of insoluble, misfolded cytoplasmic TAR DNA binding protein of 43 kDa (TDP-43). Distal axonopathy with impaired neuromuscular junctions (NMJs) before motor neuron degeneration or clinical onset of symptoms has been hypothesized as an early pathology in ALS. However, synaptic defects at the NMJ caused by TDP-43 mutations have not been characterized. In this study, we examined a previously reported zebrafish line expressing the tardbpY220X/Y220Xvariant, which results in an unstable and degraded protein. These tardbp−/−larvae, however, mature normally due to the upregulated expression of an alternative splice variant of the tardbp paralog tardbp-like, or tardbpl. We generated a mutant line with a CRISPR/Cas9-mediated 5-base pair deletion encompassing the ATG start codon of tardbpl and in-crossed these with tardbp−/−mutants to obtain tardbp−/−and tardbpl−/−double mutants, herein referred to as hom/hom. We subsequently characterized morphological, coiling, locomotor, synaptic, and NMJ structural abnormalities in the hom/hom mutants and in their genotypic controls. We observed that hom/hom mutants displayed gross morphological defects, early lethality, reduced locomotor function, aberrant quantal transmission, and perturbed synapse architecture at the NMJ. We further employed pharmacological manipulations in an effort to rescue phenotypic defects and observed that tardbp+/−; tardbpl−/−(herein referred to as het/hom) mutants, but not hom/hom mutants, were sensitive to chronic treatments of BAY K 8644, an L-type calcium channel agonist. This result highlights the importance of partial vs. complete loss of allelic functions of TDP-43. NEW & NOTEWORTHY This study highlights the importance of partial vs. complete loss of allelic functions of TDP-43 in a zebrafish loss of function model, thus making it an attractive tool for drug screening approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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