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Enregistrement W2901987869 · doi:10.1371/journal.pone.0207848

Prediction of findings at screening colonoscopy using a machine learning algorithm based on complete blood counts (ColonFlag)

2018· article· en· W2901987869 sur OpenAlexafffundabout
Robert J. Hilsden, Steven J. Heitman, Barak Mizrahi, Steven A. Narod, Ran Goshen

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Screening and Detection
Établissements canadiensPublic Health OntarioWomen's College HospitalUniversity of TorontoUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesUniversity of Calgary
Mots-clésColonoscopyColorectal cancerMedicineOdds ratioInternal medicineAsymptomaticCancerPopulationGastroenterologyBlood test

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adenomatous polyps are a common precursor lesion for colorectal cancer. ColonFlag is a machine- learning-based algorithm that uses basic patient information and complete blood cell counts (CBC) to identify individuals at elevated risk of colorectal cancer for intensified screening. The purpose of this study was to determine whether ColonFlag is also able to predict the presence of high risk adenomatous polyps at colonoscopy. This study was conducted at a large colon cancer screening center in Calgary, Alberta. The study population included asymptomatic individuals between the ages of 50 and 75 who underwent a screening colonoscopy between January 2013 and June 2015. All subjects had at least one CBC result within the year prior to colonoscopy. Based on age, sex, red blood cell parameters, inflammatory cells and platelets, the ColonFlag algorithm generated a score from 0 to 100. We compared the ability of the ColonFlag test result to discriminate between individuals who were found to have a high risk polyp and those with a normal colonoscopy. Among the 17,676 individuals who underwent a screening colonoscopy there were 1,014 found to have a high risk precancerous lesion (5.7%) and 60 were found to have colorectal cancer (0.3%). At a specificity of 95%, the odds ratio for a positive ColonFlag was 2.0 for those with an advanced precancerous lesion compared with those with a normal colonoscopy. The odds ratio did not vary according to patient subgroup, colorectal cancer location or stage. ColonFlag is a passive test that can use routine blood test results to help identify individuals at elevated risk for high risk precancerous polyps as well as frank colorectal cancer. These individuals may be targeted in an effort to achieve greater compliance with conventional screening tests.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,783
Score d'incertitude au seuil0,439

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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