Identification and expression analysis of <i>LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN</i> (<i>LBD</i>) transcription factor genes in <i>Fragaria vesca </i>
Notice bibliographique
Résumé
The LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN (LBD) gene family encodes plant-specific transcription factors that play crucial roles in the growth and development in many plant species. However, no systematic study of LBD genes has been conducted in strawberry. In this study, 35 LBD (FvLBD) genes were identified in the diploid woodland strawberry genome (Fragaria vesca L.). These LBD proteins could be classified into two groups based on the structure of their lateral organ boundaries domain. The promoters of FvLBD genes contain different regulatory elements associated with potential response to different environmental stimuli and plant developmental signals. Furthermore, we analysed the expression patterns of the LBD genes during the callus formation in strawberry and the results suggested that FvLBD16 might play a prominent role in the regulation of callus formation. In addition, we investigated the expression profiles of FvLBD genes during early fruit development based on transcriptome data. We found that some FvLBD genes show a specific expression pattern. These results indicate that FvLBD genes may have a function in early fruit development. Together, the present study provides insights into possible functions of FvLBD genes and provides a basis for further functional research of FvLBD proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».